More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3105 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_3105  hypothetical protein  100 
 
 		 505 aa  1012    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4854  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.86 
 
 		 546 aa  413  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3575  serine/threonine protein kinase  45.58 
 
 		 498 aa  369  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9373  hypothetical protein  46.86 
 
 		 503 aa  341  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4964  putative FHA domain containing protein  37.55 
 
 		 532 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4684  serine/threonine protein kinase  41.99 
 
 		 622 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.734593  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3716  hypothetical protein  40.6 
 
 		 596 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00638349 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2145  hypothetical protein  28.8 
 
 		 473 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5083  hypothetical protein  28.91 
 
 		 544 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474082  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5094  serine/threonine protein kinase  25.66 
 
 		 535 aa  120  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000566508 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4500  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.69 
 
 		 533 aa  109  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0420485  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9039  serine/threonine protein kinase  34.43 
 
 		 594 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7325  serine/threonine protein kinase  33.81 
 
 		 730 aa  104  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0416051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6434  serine/threonine protein kinase  34.3 
 
 		 477 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317855 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4576  serine/threonine protein kinase  35.32 
 
 		 556 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0563383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  30.1 
 
 		 1224 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  32.03 
 
 		 1217 aa  96.7  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  26.91 
 
 		 1184 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  25.7 
 
 		 691 aa  90.9  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  27.56 
 
 		 625 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  25.35 
 
 		 692 aa  90.5  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39640  hypothetical protein  26 
 
 		 509 aa  89  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26930  hypothetical protein  33.74 
 
 		 754 aa  89.4  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.01 
 
 		 650 aa  87.8  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  27.72 
 
 		 403 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  33.59 
 
 		 1652 aa  85.1  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.57 
 
 		 579 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.92 
 
 		 627 aa  83.6  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4534  serine/threonine protein kinase  28.9 
 
 		 679 aa  83.6  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  28.69 
 
 		 624 aa  83.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  28.69 
 
 		 624 aa  83.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  28.69 
 
 		 624 aa  83.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  26.06 
 
 		 703 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  25.14 
 
 		 1219 aa  82.8  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  33.49 
 
 		 559 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.25 
 
 		 662 aa  82  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  29.3 
 
 		 658 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  28.57 
 
 		 625 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  28.97 
 
 		 618 aa  81.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.71 
 
 		 627 aa  80.9  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.41 
 
 		 635 aa  80.5  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5031  serine/threonine protein kinase  26.89 
 
 		 338 aa  79.7  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270554 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  32.53 
 
 		 501 aa  79  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  28.46 
 
 		 468 aa  79  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3367  hypothetical protein  40.74 
 
 		 690 aa  78.2  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  27.82 
 
 		 666 aa  78.2  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  26.88 
 
 		 626 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0171  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 		 575 aa  77.8  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.495174 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.95 
 
 		 668 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2669  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.11 
 
 		 728 aa  77.4  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  25.51 
 
 		 621 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.09 
 
 		 598 aa  77  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  25.4 
 
 		 646 aa  76.6  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.35 
 
 		 641 aa  76.3  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0689  kinase domain protein  27.71 
 
 		 796 aa  75.9  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2939  serine/threonine protein kinase  29.22 
 
 		 445 aa  75.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  30.17 
 
 		 646 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  26.21 
 
 		 563 aa  75.5  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.56 
 
 		 681 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  28.81 
 
 		 593 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.38 
 
 		 681 aa  75.1  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  32.3 
 
 		 468 aa  74.7  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  26.39 
 
 		 692 aa  74.7  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  28.72 
 
 		 596 aa  74.7  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 		 710 aa  74.7  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37930  hypothetical protein  35.76 
 
 		 612 aa  74.3  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.74 
 
 		 602 aa  74.3  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.08 
 
 		 591 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  32.48 
 
 		 562 aa  73.9  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  24.28 
 
 		 641 aa  73.6  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6472  serine/threonine protein kinase  34.16 
 
 		 497 aa  73.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0240846 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  26.1 
 
 		 625 aa  73.6  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1251  serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 		 568 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4508  serine/threonine protein kinase  29.9 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  25.12 
 
 		 673 aa  73.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1254  serine/threonine protein kinase  30.08 
 
 		 522 aa  73.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00190  serine/threonine protein kinase  26.35 
 
 		 663 aa  73.2  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.41 
 
 		 707 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 		 615 aa  73.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  29.7 
 
 		 951 aa  73.2  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  31.21 
 
 		 487 aa  72.8  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  27.05 
 
 		 1358 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3283  serine/threonine protein kinase  28.05 
 
 		 398 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2149  serine/threonine protein kinase  28.21 
 
 		 480 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.38 
 
 		 584 aa  72  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2796  serine/threonine protein kinase  32.24 
 
 		 982 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0264511  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3272  serine/threonine protein kinase  28.05 
 
 		 398 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  31.01 
 
 		 528 aa  71.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3334  serine/threonine protein kinase  28.05 
 
 		 398 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.502424  normal  0.33642 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2546  hypothetical protein  31.54 
 
 		 561 aa  71.6  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.444477  normal  0.208809 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.61 
 
 		 715 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  27.62 
 
 		 642 aa  71.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.33 
 
 		 607 aa  71.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0363  serine/threonine protein kinase  35.37 
 
 		 497 aa  70.9  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3370  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.32 
 
 		 1183 aa  70.9  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2528  serine/threonine protein kinase  31.85 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00115723  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1364  serine/threonine protein kinase  36 
 
 		 790 aa  70.9  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.498929  normal  0.194256 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.17 
 
 		 551 aa  70.9  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  26.15 
 
 		 604 aa  70.9  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.27 
 
 		 676 aa  70.9  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>