More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0473 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  100 
 
 		 124 aa  253  9e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  94.31 
 
 		 136 aa  238  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  91.94 
 
 		 124 aa  235  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1290  30S ribosomal protein S12  90.24 
 
 		 127 aa  230  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0659  30S ribosomal protein S12  91.06 
 
 		 127 aa  230  6e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254594  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1564  30S ribosomal protein S12  89.43 
 
 		 125 aa  226  8e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0581883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1539  30S ribosomal protein S12  89.43 
 
 		 125 aa  226  8e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16341  30S ribosomal protein S12  87.8 
 
 		 123 aa  225  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.369961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0052  30S ribosomal protein S12  88.62 
 
 		 123 aa  226  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23611  30S ribosomal protein S12  87.8 
 
 		 125 aa  224  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.436727 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17021  30S ribosomal protein S12  87.8 
 
 		 124 aa  224  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0323  30S ribosomal protein S12  87.8 
 
 		 124 aa  224  4e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.436822  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16911  30S ribosomal protein S12  87.8 
 
 		 125 aa  223  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1603  30S ribosomal protein S12  87.8 
 
 		 124 aa  223  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17141  30S ribosomal protein S12  86.99 
 
 		 124 aa  223  8e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.387317  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2019  30S ribosomal protein S12  87.8 
 
 		 124 aa  222  1e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19521  30S ribosomal protein S12  85.37 
 
 		 124 aa  220  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1077  30S ribosomal protein S12  84.55 
 
 		 124 aa  219  9e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 123 aa  215  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 123 aa  214  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 123 aa  214  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1063  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  211  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000011853  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0675  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00545662  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  81.45 
 
 		 135 aa  211  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 123 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1180  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 124 aa  211  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275804  normal  0.0539297 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3925  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 		 124 aa  211  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  81.45 
 
 		 129 aa  211  3.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 123 aa  210  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  210  4.9999999999999996e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2338  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 125 aa  210  4.9999999999999996e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000575958  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0284  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 		 136 aa  209  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000309063  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 135 aa  209  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0577  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 124 aa  209  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6054  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 124 aa  209  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0271  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 126 aa  208  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0220  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  208  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000630102  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3442  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 126 aa  208  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000394059  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1856  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 		 137 aa  208  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0880493  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 126 aa  208  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2764  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 126 aa  208  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0416814  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1341  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  208  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4512  ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 124 aa  208  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1800  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 123 aa  208  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.278795  normal  0.143842 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0262  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 126 aa  208  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822385  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0682  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 124 aa  208  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0343  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 126 aa  208  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  208  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0301  30S ribosomal protein S12  79.84 
 
 		 124 aa  208  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000933242 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 126 aa  208  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 126 aa  208  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1606  ribosomal protein S12  80.65 
 
 		 126 aa  207  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.524218 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0704  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  207  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000738801  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0400  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 125 aa  207  4e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000378884  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0274  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 125 aa  207  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000134966  unclonable  0.0000000817173 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1551  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  207  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00133332  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3302  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 125 aa  207  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000119116  hitchhiker  0.00857233 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3024  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 125 aa  207  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000203236  decreased coverage  0.00243586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2955  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 125 aa  207  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0353473  hitchhiker  0.000186229 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0386  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 125 aa  207  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0122913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0928  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  206  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000041416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3333  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  206  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70711e-17 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  207  6e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1081  ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  206  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 128 aa  206  8e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3782  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 126 aa  206  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00172098  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0921  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 124 aa  206  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3073  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 126 aa  206  8e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0733593  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0393  ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  206  8e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.844601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3751  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 126 aa  206  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0182749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3809  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 126 aa  206  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4326  ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 139 aa  206  8e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  206  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  206  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0389  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 126 aa  206  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0364  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 126 aa  206  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2845  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 126 aa  206  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 128 aa  205  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3185  30S ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 125 aa  206  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0661629  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2234  30S ribosomal protein S12  80.99 
 
 		 135 aa  206  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000995166  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2731  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  205  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0268  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 125 aa  206  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000012453  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0309  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 126 aa  206  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102814  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0271  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  205  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.377555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1426  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 126 aa  206  1e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0159812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0273  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 125 aa  206  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0102222  hitchhiker  0.00000133028 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3473  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 126 aa  205  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1919  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 126 aa  205  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000102606  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2637  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 126 aa  205  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2664  ribosomal protein S12  79.34 
 
 		 122 aa  205  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3800  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 125 aa  205  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000117431  n/a   
 
 
 
NC_008785  BMASAVP1_A3174  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 126 aa  205  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00103484  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6619  30S ribosomal protein S12  79.84 
 
 		 124 aa  205  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3861  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 125 aa  204  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1221  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 124 aa  205  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000786754  hitchhiker  0.00402882 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1770  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 123 aa  205  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0593417  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0389  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 124 aa  205  2e-52  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0333  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 125 aa  204  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769915 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0451  30S ribosomal protein S12  77.42 
 
 		 127 aa  204  3e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1327  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  204  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139307  normal  0.0632073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>