More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1069 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0906  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.96 
 
 
665 aa  645    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266442  normal  0.140233 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1069  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  100 
 
 
667 aa  1385    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2056  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.53 
 
 
666 aa  703    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4048  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.82 
 
 
660 aa  664    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1280  protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase  48.99 
 
 
684 aa  636    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.65747  normal  0.248461 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1929  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  59.46 
 
 
680 aa  813    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.329265  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5912  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.68 
 
 
657 aa  685    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3528  erythromycin esterase  57.64 
 
 
447 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.109447  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  51.35 
 
 
885 aa  468  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  51.35 
 
 
885 aa  468  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  54.03 
 
 
884 aa  465  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0937  erythromycin esterase  51.24 
 
 
445 aa  464  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19320  carboxylic ester hydrolase  52.82 
 
 
428 aa  441  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36472  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3231  hypothetical protein  48.72 
 
 
455 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2464  erythromycin esterase  48.95 
 
 
455 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0683929  normal  0.679688 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3359  erythromycin esterase  48.73 
 
 
447 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0117563  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0062  erythromycin esterase  47.71 
 
 
436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.716314  normal  0.483974 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2706  Erythromycin esterase  46.89 
 
 
462 aa  409  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215837  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2655  Erythromycin esterase  49.52 
 
 
448 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2186  erythromycin esterase  48.58 
 
 
682 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231601  normal  0.689672 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04105  erythromycin esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05850)  48.58 
 
 
453 aa  382  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1164  erythromycin esterase  47.55 
 
 
457 aa  374  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1970  Erythromycin esterase  47.87 
 
 
448 aa  360  5e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265933  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2322  Erythromycin esterase  43.11 
 
 
669 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2391  erythromycin esterase  47.99 
 
 
452 aa  356  5.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1393  erythromycin esterase  43.18 
 
 
681 aa  345  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0175546  normal  0.392686 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2872  erythromycin esterase  45.18 
 
 
668 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.104564  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0623  erythromycin esterase family protein  44.5 
 
 
442 aa  337  5e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7038  erythromycin esterase  45.48 
 
 
440 aa  326  9e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4518  Erythromycin esterase  43.5 
 
 
428 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.578845 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4386  Erythromycin esterase  43.5 
 
 
428 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.17487  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5196  erythromycin esterase  44.68 
 
 
434 aa  321  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12067  hypothetical protein  45.22 
 
 
681 aa  318  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4988  erythromycin esterase  44.99 
 
 
681 aa  318  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1108  erythromycin esterase  43.82 
 
 
679 aa  317  4e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0293392  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1097  erythromycin esterase  43.82 
 
 
679 aa  317  4e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511682  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1081  erythromycin esterase  43.82 
 
 
845 aa  317  5e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00882815  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1453  hypothetical protein  40.5 
 
 
445 aa  314  3.9999999999999997e-84  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1191  Erythromycin esterase  41.39 
 
 
432 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.295106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3666  erythromycin esterase  38.9 
 
 
418 aa  293  5e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.895464  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2047  erythromycin esterase  39.53 
 
 
443 aa  293  5e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4043  erythromycin esterase  38.9 
 
 
418 aa  293  7e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.171008 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3856  Erythromycin esterase  40.59 
 
 
427 aa  291  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3145  Erythromycin esterase  39.23 
 
 
432 aa  266  8.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.044182  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0447  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  63.85 
 
 
245 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522116  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2838  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  57 
 
 
225 aa  248  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0380  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  58.37 
 
 
240 aa  246  9e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3266  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  60.39 
 
 
219 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0994  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  59.9 
 
 
219 aa  239  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.827689  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1616  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.04 
 
 
219 aa  233  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0577413  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6264  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.79 
 
 
247 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.34405 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14460  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.18 
 
 
223 aa  221  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1420  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  53.24 
 
 
216 aa  221  5e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00081136  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6438  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53.43 
 
 
394 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.204863 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2480  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53.02 
 
 
214 aa  214  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1524  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.31 
 
 
216 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1427  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.38 
 
 
217 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000012411  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2618  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53.74 
 
 
217 aa  212  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000759722  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1901  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
213 aa  211  4e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0370891  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4285  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.8 
 
 
217 aa  211  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3811  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.31 
 
 
218 aa  210  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0474  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.75 
 
 
219 aa  209  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.462994 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2892  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.19 
 
 
219 aa  207  7e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.640231  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1086  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.77 
 
 
217 aa  207  7e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00685852  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4629  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53.59 
 
 
216 aa  206  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0802433  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2355  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.42 
 
 
220 aa  206  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0265  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.68 
 
 
233 aa  205  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4262  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.9 
 
 
228 aa  204  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.207486 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1394  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.5 
 
 
220 aa  203  7e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2850  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.52 
 
 
216 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.104765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1297  Erythromycin esterase  34.74 
 
 
401 aa  201  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2738  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
215 aa  200  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101147  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0318  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.15 
 
 
215 aa  200  7e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.975543 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4121  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53.23 
 
 
306 aa  200  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.879301  normal  0.299077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3331  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.02 
 
 
236 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000130408  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4779  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.15 
 
 
212 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0565845  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2742  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.54 
 
 
221 aa  197  7e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0989  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.78 
 
 
218 aa  196  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0761  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  41.13 
 
 
462 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0936  hypothetical protein  41.13 
 
 
462 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0412  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.47 
 
 
215 aa  194  6e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0252125 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2790  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  47.8 
 
 
244 aa  193  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1354  protein-L-isoaspartate(D-aspartate)O- methyltransferase  48.61 
 
 
245 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697217 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0372  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.77 
 
 
228 aa  192  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2077  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.07 
 
 
213 aa  191  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000601423  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1190  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.13 
 
 
213 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000833235  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0773  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  40.43 
 
 
462 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1556  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53.06 
 
 
206 aa  189  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2473  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.24 
 
 
222 aa  188  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1925  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.04 
 
 
224 aa  187  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0151  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.48 
 
 
236 aa  187  6e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1699  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.03 
 
 
210 aa  187  7e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1922  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.06 
 
 
220 aa  187  8e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2225  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.11 
 
 
220 aa  186  9e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2684  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.55 
 
 
206 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2831  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.39 
 
 
232 aa  185  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1978  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.5 
 
 
219 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.145869  normal  0.127834 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0258  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
217 aa  183  9.000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1211  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.78 
 
 
219 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1127  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.45 
 
 
223 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>