174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_R0006 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  184  2.0000000000000003e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000515355  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0054  tRNA-Ser  83.72 
 
 		 93 bp  60  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00119077  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0055  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  60  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267129  decreased coverage  0.00667761 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0053  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  60  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0055  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0814069  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0054  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.144676  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0051  tRNA-Ser  94.59 
 
 		 89 bp  58  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0055  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.223526  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0033  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000107313  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0034  tRNA-Ser  96.97 
 
 		 92 bp  58  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0060  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000000115188  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0053  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  58  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.256753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0015  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118719  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0033  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  58  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000207879  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4577  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0046  tRNA-Ser  84.34 
 
 		 92 bp  54  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00112591  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0052  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0040  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.66072  hitchhiker  0.00010969 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0037  tRNA-Ser  96.77 
 
 		 88 bp  54  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0006  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0054  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104175 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.86368  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0054  tRNA-Ser  94.12 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0042  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 93 bp  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0018  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.317107  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS01162  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0044  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.417846 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0009  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 94 bp  50.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000273575 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0046  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40906  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0029  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0042  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1916  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0034  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 96 bp  50.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0037  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.552726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0051  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.267767  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0041  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.562002  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0007  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 95 bp  50.1  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.025626  hitchhiker  0.00000743472 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0003  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 96 bp  50.1  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0044  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0041  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0730439  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0006  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0006  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0032  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.945587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0056  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.300802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0009  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0314444  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0050  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 95 bp  50.1  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0071  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.612949  normal  0.325522 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0041  tRNA-Ser  90.24 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000391887  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2055  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.311721  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0026  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.199991  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0025  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0052  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 96 bp  50.1  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0340813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0039  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.801401  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0054  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 95 bp  50.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.582085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0049  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0051  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0044  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.656811 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0001  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174874  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0029  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 95 bp  50.1  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0203924  normal  0.277974 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0050  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0567726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0039  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0837952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_627  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0031  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0876919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0027  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.796709  normal  0.0348643 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0026  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0051  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.7492  normal  0.229095 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0011  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.796085  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0004  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0020  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000474391  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0633  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 93 bp  50.1  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.248026  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0008  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.109766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0026  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0047  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.740816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0016  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.25212  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0051  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.573916  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0018  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0009  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56396 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0014  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 94 bp  50.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0049  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.430745  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0040  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0060  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0238234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0015  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00859623  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0001  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000971993  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0058  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0037  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0020  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000279597  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0005  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0026  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0027  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.361674  hitchhiker  0.00190717 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0006  tRNA-Ser  90.91 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000844947  hitchhiker  0.0000061408 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0052  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0008  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0042  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 93 bp  48.1  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.810595  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0050  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 93 bp  48.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000005871  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNASerVIMSS1309192  tRNA-Ser  88.37 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNASerVIMSS1309262  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2627  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105865  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0034  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2985  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.164752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>