46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3783 on replicon NC_008042
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008042  TM1040_3783  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  443  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.619325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0649  hypothetical protein  45.58 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3537  hypothetical protein  35.14 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0076  hypothetical protein  33.19 
 
 		 236 aa  91.7  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0088  hypothetical protein  30 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0461  hypothetical protein  31.88 
 
 		 240 aa  89.4  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0073  hypothetical protein  28.07 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1695  hypothetical protein  28.26 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01570  hypothetical protein  28.75 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1269  hypothetical protein  31.09 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174467 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0400  uncharacterized protein-like protein  29.41 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3808  RNA polymerase sigma-70 family protein  30.9 
 
 		 248 aa  71.6  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178048  normal  0.362907 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3590  hypothetical protein  30.04 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080762  normal  0.394996 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4493  hypothetical protein  29.92 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129044 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4360  hypothetical protein  29.92 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4013  uncharacterized protein-like protein  31.9 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0859661 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1295  hypothetical protein  28.99 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.785718  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1332  hypothetical protein  33.19 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3548  hypothetical protein  31.6 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1137  hypothetical protein  27.73 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0162  hypothetical protein  28.98 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.88805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0361  hypothetical protein  28.82 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4573  hypothetical protein  28.97 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5507  uncharacterized protein-like protein  31 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.250869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4257  uncharacterized protein-like protein  42.86 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.683033 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01781  hypothetical protein  27.69 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0888  hypothetical protein  28.57 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3889  uncharacterized protein-like protein  45.95 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.725868  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3747  hypothetical protein  29.41 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831367  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6587  hypothetical protein  46.38 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0308609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5177  hypothetical protein  27.39 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0972  hypothetical protein  29.49 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.221303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5200  hypothetical protein  33.52 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  29.52 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1097  hypothetical protein  27.35 
 
 		 254 aa  52.4  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3056  hypothetical protein  28.38 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2687  hypothetical protein  29.22 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3491  hypothetical protein  41.38 
 
 		 696 aa  45.8  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445779  normal  0.366165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6529  hypothetical protein  29.75 
 
 		 328 aa  45.4  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3908  hypothetical protein  31.46 
 
 		 302 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3668  hypothetical protein  31.46 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0696  transmembrane protein  29.18 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220237  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3005  hypothetical protein  28.31 
 
 		 233 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.660261  normal  0.0479294 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1718  hypothetical protein  25.53 
 
 		 242 aa  42.4  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.202927 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1817  hypothetical protein  27.43 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4227  hypothetical protein  28.46 
 
 		 294 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>