60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2568 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2568  FIST C domain protein  100 
 
 
375 aa  749    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0105627  normal  0.0110126 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3242  domain of unknown function DUF1745  48.53 
 
 
371 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0186777  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0889  hypothetical protein  44.31 
 
 
374 aa  281  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1108  domain of unknown function DUF1745  38.48 
 
 
378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1387  hypothetical protein  38.48 
 
 
378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0438  domain of unknown function DUF1745  36.34 
 
 
398 aa  190  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5581  hypothetical protein  34.27 
 
 
396 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19369  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2912  hypothetical protein  34.56 
 
 
387 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4508  hypothetical protein  33.25 
 
 
439 aa  176  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.260066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0622  hypothetical protein  33.5 
 
 
427 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3636  hypothetical protein  31.85 
 
 
408 aa  169  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0371475  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0750  domain of unknown function DUF1745  33.83 
 
 
426 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4934  hypothetical protein  32.24 
 
 
422 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0306  hypothetical protein  32.18 
 
 
447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3887  hypothetical protein  34.54 
 
 
421 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.894307 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3160  domain of unknown function DUF1745  34.54 
 
 
421 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0450  hypothetical protein  31.27 
 
 
430 aa  160  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2266  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3261  hypothetical protein  33.6 
 
 
419 aa  150  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.389498 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0360  hypothetical protein  29.7 
 
 
398 aa  134  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.435591  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1561  hypothetical protein  27.27 
 
 
404 aa  131  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1049  hypothetical protein  26.27 
 
 
406 aa  126  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0913  domain of unknown function DUF1745  27.2 
 
 
414 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0940  domain of unknown function DUF1745  27.2 
 
 
414 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4044  hypothetical protein  28.16 
 
 
401 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4241  domain of unknown function DUF1745  25.2 
 
 
411 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000432273  hitchhiker  0.00000452646 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3390  hypothetical protein  24.14 
 
 
414 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.0973611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3246  domain of unknown function DUF1745  31.97 
 
 
396 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116005  normal  0.61148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0527  hypothetical protein  29.02 
 
 
411 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.437223  hitchhiker  0.00000299697 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3113  hypothetical protein  28.08 
 
 
397 aa  100  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  hitchhiker  0.0000208643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8558  hypothetical protein  29.86 
 
 
398 aa  96.3  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24381  hypothetical protein  24.35 
 
 
429 aa  94  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1400  domain of unknown function DUF1745  30 
 
 
398 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.653815  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10639  hypothetical protein  30.52 
 
 
383 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000135133  normal  0.805152 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0281  hypothetical protein  23.59 
 
 
431 aa  90.9  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.812324  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3254  domain of unknown function DUF1745  26.69 
 
 
385 aa  89.7  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2063  hypothetical protein  23.53 
 
 
425 aa  89.4  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.748308  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4078  domain of unknown function DUF1745  25.99 
 
 
411 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1055  domain of unknown function DUF1745  28.64 
 
 
389 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1891  hypothetical protein  28.23 
 
 
391 aa  87  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10891  hypothetical protein  32.46 
 
 
386 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0091  domain of unknown function DUF1745  29.73 
 
 
383 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189874  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0444  hypothetical protein  27.27 
 
 
412 aa  79.3  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  27.83 
 
 
396 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  27.06 
 
 
402 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  26.89 
 
 
396 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  24.62 
 
 
396 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  26.17 
 
 
396 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  27.24 
 
 
416 aa  56.2  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2191  diguanylate cyclase  21.74 
 
 
806 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00068502 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  29.02 
 
 
395 aa  51.2  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  26.04 
 
 
381 aa  49.3  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2659  hypothetical protein  26.6 
 
 
406 aa  46.6  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  27.81 
 
 
400 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1154  hypothetical protein  28.57 
 
 
338 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0996  hypothetical protein  25.86 
 
 
366 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0343118  normal  0.112953 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0852  hypothetical protein  25.86 
 
 
366 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.214609  normal  0.0568349 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  25.23 
 
 
1101 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  26.42 
 
 
373 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  28.14 
 
 
417 aa  43.5  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  27.6 
 
 
395 aa  42.7  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>