32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2334 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2334  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  100 
 
 		 215 aa  427  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1500  putative outer-membrane protein  43.39 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733507 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1117  putative outer-membrane protein  47.85 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0367384  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  25.73 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1303  hypothetical protein  31.37 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.13528  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  25.1 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1434  porin  32.59 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170273 
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  26.17 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3008  hypothetical protein  26.74 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4199  hypothetical protein  27.64 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0971  outer membrane protein, putative  26.6 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1437  hypothetical protein  30.43 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0415  outer membrane protein  29.11 
 
 		 255 aa  52  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4129  putative outer membrane protein  32.14 
 
 		 250 aa  51.6  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  26.73 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0072  outer membrane immunogenic protein  30.81 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.17135e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  27.45 
 
 		 228 aa  48.5  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2794  opacity protein and related surface antigens-like protein  30.77 
 
 		 188 aa  48.1  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.970825  normal  0.570221 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  26.09 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1973  OmpA-like transmembrane region  28.21 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5652  porin  26.57 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303382  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2342  porin  28.8 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2979  outer membrane protein  29.03 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  31.86 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4312  porin  22.8 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  31.01 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040892 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1234  porin  31.78 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  0.0000166827 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1238  outer membrane protein, 31 kDa  33.79 
 
 		 234 aa  42.4  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2815  outer membrane insertion C-terminal signal  25 
 
 		 997 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.71405  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0866  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  31.13 
 
 		 243 aa  42  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649997 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0133  porin  24.87 
 
 		 229 aa  42  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.679493  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2587  porin  26.22 
 
 		 213 aa  41.6  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>