14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_4199 on replicon NC_008738
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008738  Maqu_4199  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2334  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  26.82 
 
 
215 aa  55.8  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3008  hypothetical protein  29.69 
 
 
172 aa  52.8  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1303  hypothetical protein  30.53 
 
 
185 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.13528  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1437  hypothetical protein  26.79 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0784  porin  32.65 
 
 
212 aa  48.5  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.0786165 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1500  putative outer-membrane protein  27.43 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.733507 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1088  porin  30.23 
 
 
211 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000040892 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1234  porin  30.23 
 
 
211 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.248035  hitchhiker  0.0000166827 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1561  outer membrane protein  23.39 
 
 
212 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5652  porin  25.91 
 
 
207 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303382  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_004310  BR0701  outer-membrane protein Omp25  23.75 
 
 
213 aa  43.1  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1215  omp25/ropB family outer membrane protein  22.09 
 
 
281 aa  43.5  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  unclonable  9.29798e-27  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1117  putative outer-membrane protein  28.24 
 
 
208 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0367384  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>