41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0006 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0006  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 345 aa  702    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0102179  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  23.84 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  23.67 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  24.2 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  24.33 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  30.71 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  28 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1214  rod shape-determining protein MreC  26.32 
 
 		 283 aa  51.6  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0182396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  26.78 
 
 		 288 aa  50.1  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  23.38 
 
 		 324 aa  49.3  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0867  rod shape-determining protein MreC  35 
 
 		 265 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000732339  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1739  rod shape-determining protein MreC  40 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  22.87 
 
 		 285 aa  48.5  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1460  rod shape-determining protein MreC  29.71 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590087  hitchhiker  0.00000334343 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  29.45 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  25.81 
 
 		 277 aa  47.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  38.75 
 
 		 311 aa  47.4  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  29.55 
 
 		 286 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  30.91 
 
 		 275 aa  46.6  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  32.98 
 
 		 283 aa  46.6  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0503  rod shape-determining protein MreC  38.27 
 
 		 312 aa  46.6  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00353407 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  33.82 
 
 		 288 aa  46.6  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  26.32 
 
 		 285 aa  46.2  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  25.1 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  23.79 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  23.94 
 
 		 288 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  32.69 
 
 		 279 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4663  rod shape-determining protein MreC  22.81 
 
 		 255 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  21.25 
 
 		 274 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  42.65 
 
 		 311 aa  43.9  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  26.97 
 
 		 369 aa  43.9  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  33.82 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  54.05 
 
 		 348 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  25.23 
 
 		 292 aa  43.5  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  42.59 
 
 		 336 aa  43.5  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  51.43 
 
 		 307 aa  43.9  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  26.49 
 
 		 369 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  30.61 
 
 		 274 aa  43.5  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  54.05 
 
 		 348 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  23.56 
 
 		 285 aa  43.5  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  29.85 
 
 		 286 aa  42.7  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>