198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11678 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11678  chalcone synthase pks10  100 
 
 
353 aa  703    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441245  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11683  chalcone synthase pks11  74.22 
 
 
353 aa  536  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.133328  normal  0.163848 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5140  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  67.14 
 
 
360 aa  485  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.734202  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1196  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  66.57 
 
 
357 aa  481  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1059  chalcone and stilbene synthases-like protein  65.62 
 
 
350 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1075  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  65.62 
 
 
350 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1086  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  66.19 
 
 
350 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0962351  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5949  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  58.76 
 
 
352 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207884  normal  0.0327105 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5115  chalcone and stilbene synthase domain protein  58.12 
 
 
364 aa  366  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1949  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  55.62 
 
 
350 aa  344  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.164394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2367  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  49.28 
 
 
366 aa  325  6e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.980596  normal  0.560252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2328  chalcone and stilbene synthases-like protein  53.8 
 
 
306 aa  318  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.579896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2375  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  53.8 
 
 
306 aa  318  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3991  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  48.87 
 
 
357 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222559  normal  0.414224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2104  chalcone and stilbene synthase domain protein  47.08 
 
 
361 aa  304  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00500  predicted naringenin-chalcone synthase  50.28 
 
 
373 aa  301  9e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.281948  normal  0.904387 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2602  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  44.19 
 
 
354 aa  288  8e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3105  chalcone and stilbene synthases-like  43.02 
 
 
349 aa  280  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4185  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  45.98 
 
 
355 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0192422  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0416  chalcone and stilbene synthase domain protein  48.9 
 
 
378 aa  255  9e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0415  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  48.73 
 
 
378 aa  252  7e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0387  chalcone/stilbene synthase-like  46.42 
 
 
369 aa  249  6e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.363189  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1160  chalcone and stilbene synthase domain protein  44.63 
 
 
359 aa  236  4e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.640364  hitchhiker  0.0041842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0021  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  39.3 
 
 
354 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2733  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  34.84 
 
 
373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0430  chalcone and stilbene synthase domain protein  38.2 
 
 
350 aa  208  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5033  chalcone and stilbene synthase domain protein  34.54 
 
 
350 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.952361  normal  0.260327 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0398  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  38.01 
 
 
350 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18522 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1642  chalcone and stilbene synthase domain protein  32.06 
 
 
350 aa  199  7e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00774069 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1903  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  40.11 
 
 
350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000467282 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2390  chalcone and stilbene synthase domain protein  36.31 
 
 
355 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3808  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  29.64 
 
 
350 aa  189  5.999999999999999e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0202  putative Type III polyketide synthase  33.24 
 
 
350 aa  186  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1888  chalcone and stilbene synthase domain protein  38.66 
 
 
370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361608  normal  0.338174 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3187  chalcone and stilbene synthase domain protein  30.09 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.397507  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10908  naringenin-chalcone synthase  30.9 
 
 
359 aa  181  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.559133  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4105  chalcone and stilbene synthases-like  33.04 
 
 
394 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137291  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5652  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  34.97 
 
 
352 aa  166  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1684  chalcone and stilbene synthases-like protein  37.39 
 
 
378 aa  166  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.436758  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1084  chalcone and stilbene synthases-like protein  36.18 
 
 
347 aa  163  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1868  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  33.43 
 
 
349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0226  naringenin-chalcone synthase  33.99 
 
 
349 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239873  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0145  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  34.92 
 
 
343 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.842427 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0466  chalcone and stilbene synthase domain protein  31.29 
 
 
373 aa  143  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1740  chalcone and stilbene synthase domain protein  29.67 
 
 
377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4396  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30.81 
 
 
368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20410  predicted naringenin-chalcone synthase  32.26 
 
 
351 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.194613  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4821  chalcone and stilbene synthase domain protein  33.95 
 
 
344 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1028  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  30.28 
 
 
349 aa  123  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4977  chalcone and stilbene synthase domain protein  30.56 
 
 
365 aa  122  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110388  normal  0.0854213 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2809  Naringenin-chalcone synthase  31.8 
 
 
413 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3232  chalcone and stilbene synthase domain protein  30.1 
 
 
363 aa  119  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11401  hypothetical protein  26.54 
 
 
393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0421  chalcone synthase  27.37 
 
 
362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.299605 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18741  chalcone synthase (CHS)  32.55 
 
 
364 aa  116  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.406295 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2532  chalcone and stilbene synthase domain protein  25.46 
 
 
404 aa  116  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197428 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2458  chalcone and stilbene synthases-like  29.38 
 
 
366 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155051  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1339  naringenin-chalcone synthase  29.27 
 
 
363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.538359  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0256  naringenin-chalcone synthase  25 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.524336  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2037  Naringenin-chalcone synthase  24.73 
 
 
656 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629301  normal  0.879643 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2112  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  28.69 
 
 
361 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.454766  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4712  naringenin-chalcone synthase  29.92 
 
 
357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2198  naringenin-chalcone synthase  30.98 
 
 
404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.109224  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3794  naringenin-chalcone synthase  24.26 
 
 
362 aa  110  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.21941 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2326  chalcone and stilbene synthase domain protein  28.48 
 
 
393 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.190568  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04550  predicted naringenin-chalcone synthase  30.03 
 
 
382 aa  106  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3391  Naringenin-chalcone synthase  31.13 
 
 
360 aa  106  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2676  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30.03 
 
 
354 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3635  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  28.8 
 
 
344 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1939  Naringenin-chalcone synthase  31.49 
 
 
399 aa  96.3  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000153142 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4264  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30.7 
 
 
368 aa  94.4  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.188151 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18900  predicted naringenin-chalcone synthase  27.92 
 
 
396 aa  92  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0312297  normal  0.351534 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4694  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  30.31 
 
 
349 aa  87.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3897  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  23.91 
 
 
406 aa  87.4  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3899  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  25.08 
 
 
406 aa  87.4  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.824254  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29550  Type III polyketide synthase  26.38 
 
 
406 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.96869  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1186  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  29.5 
 
 
376 aa  76.3  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.857577  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29530  Type III polyketide synthase  25.46 
 
 
409 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0749  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.03 
 
 
310 aa  63.2  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000257819  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0229  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.42 
 
 
330 aa  62.8  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1757  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.94 
 
 
319 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000146713  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2575  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.94 
 
 
319 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000148386  normal  0.052755 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1717  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.94 
 
 
319 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441505  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1714  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.94 
 
 
319 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000275042  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0373  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.58 
 
 
324 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1699  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.59 
 
 
334 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.969415  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0350  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24 
 
 
324 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.110992  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1338  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.75 
 
 
327 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4114  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.13 
 
 
310 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1082  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.76 
 
 
310 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1228  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.77 
 
 
310 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1630  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.08 
 
 
324 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1293  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.4 
 
 
310 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1095  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.76 
 
 
310 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1077  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.76 
 
 
310 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1071  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.76 
 
 
310 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000173774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1184  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.76 
 
 
310 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1332  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.4 
 
 
310 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.985696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1255  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.05 
 
 
310 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1580  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.6 
 
 
319 aa  57.8  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000016033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>