More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11366 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11366  cysteine synthase B cysM  100 
 
 		 189 aa  376  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  9.90079e-22  normal  0.290845 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2354  cysteine synthase  83.23 
 
 		 324 aa  251  6e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.897277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4291  cysteine synthases  83.85 
 
 		 320 aa  248  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.512917 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3871  cysteine synthase  74.84 
 
 		 315 aa  245  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1728  cysteine synthase B  76.1 
 
 		 315 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285366 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1687  cysteine synthase  77.36 
 
 		 315 aa  245  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00358215  hitchhiker  0.00000672149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1312  cysteine synthase  74.1 
 
 		 320 aa  245  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2368  cysteine synthase  77.36 
 
 		 315 aa  245  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1358  cysteine synthase  72.67 
 
 		 316 aa  244  4.9999999999999997e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29160  cysteine synthase  74.38 
 
 		 316 aa  244  6.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3834  cysteine synthase  82.5 
 
 		 323 aa  244  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.124032 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1967  cysteine synthase  75.62 
 
 		 326 aa  243  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237562  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0938  cysteine synthase  73.58 
 
 		 315 aa  241  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.685376 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3848  cysteine synthase  81.88 
 
 		 323 aa  240  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3922  cysteine synthase  81.88 
 
 		 323 aa  240  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7559  cysteine synthase  71.86 
 
 		 315 aa  239  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0383  cysteine synthase  72.96 
 
 		 315 aa  232  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0544064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1698  cysteine synthase  75 
 
 		 317 aa  229  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0137932  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1291  cysteine synthase  79.38 
 
 		 328 aa  228  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1011  cysteine synthase  73.12 
 
 		 316 aa  223  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0868  cysteine synthase  74.84 
 
 		 315 aa  218  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5652  cysteine synthase  75.47 
 
 		 315 aa  212  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.397691  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1541  cysteine synthase  70.44 
 
 		 316 aa  209  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1102  cysteine synthase  72.96 
 
 		 321 aa  207  7e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0991  cysteine synthase  71.7 
 
 		 337 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145876  normal  0.133112 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  41.67 
 
 		 295 aa  111  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1846  cysteine synthase  45.96 
 
 		 323 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3031  cysteine synthase B  42.36 
 
 		 296 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0787  cysteine synthase B  42.66 
 
 		 300 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.280782 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1352  cysteine synthase B  40.38 
 
 		 297 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.078483  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0917  cysteine synthase B  42.36 
 
 		 300 aa  106  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  39.22 
 
 		 295 aa  105  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0858  cysteine synthase B  40.56 
 
 		 300 aa  104  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.947605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5857  cysteine synthase B  39.16 
 
 		 290 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  38.41 
 
 		 297 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2221  cysteine synthase B  39.87 
 
 		 295 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1287  cysteine synthase B  40.97 
 
 		 299 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.257463 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  41.26 
 
 		 308 aa  102  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0731  cysteine synthase B  38.46 
 
 		 311 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1296  cysteine synthase B  41.26 
 
 		 300 aa  102  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0935  cysteine synthase B  38.89 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0576  cysteine synthase B  39.16 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353475  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1014  cysteine synthase B  39.16 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.440167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0931  cysteine synthase B  38.89 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1055  cysteine synthase B  39.16 
 
 		 325 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2937  cysteine synthase B  38.89 
 
 		 303 aa  99  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2900  cysteine synthase B  40.56 
 
 		 301 aa  98.6  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2249  cysteine synthase B  36.81 
 
 		 300 aa  98.6  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1987  cysteine synthase B  40.28 
 
 		 306 aa  98.6  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121319 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1636  cysteine synthase B  35.8 
 
 		 298 aa  97.8  8e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0418  cysteine synthase B  38.19 
 
 		 300 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2560  cysteine synthase B  39.16 
 
 		 300 aa  97.1  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2984  cysteine synthase B  38.19 
 
 		 300 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0211  cysteine synthase B  38.19 
 
 		 303 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2874  cysteine synthase B  38.19 
 
 		 303 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1646  cysteine synthase B  38.89 
 
 		 303 aa  97.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0938  cysteine synthase B  38.19 
 
 		 303 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2386  cysteine synthase B  39.86 
 
 		 301 aa  97.1  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  39.73 
 
 		 302 aa  97.1  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2562  cysteine synthase B  38.19 
 
 		 303 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1132  cysteine synthase  38.46 
 
 		 301 aa  96.7  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134492 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0664  cysteine synthase B  39.16 
 
 		 301 aa  96.7  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  34.93 
 
 		 297 aa  96.3  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2832  cysteine synthase B  38.89 
 
 		 294 aa  95.9  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2454  cysteine synthase  38.89 
 
 		 294 aa  95.9  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0944548  normal  0.580019 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4168  cysteine synthase B  37.76 
 
 		 300 aa  95.5  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  35.29 
 
 		 299 aa  94.7  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1733  cysteine synthase B  37.16 
 
 		 301 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3172  cysteine synthase B  36.36 
 
 		 300 aa  94.7  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  36.81 
 
 		 297 aa  94.4  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2212  cysteine synthase B  39.16 
 
 		 307 aa  94  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199065 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2378  cysteine synthase B  35.66 
 
 		 300 aa  94  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098453  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2362  cysteine synthase B  34.27 
 
 		 290 aa  93.2  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.688309  normal  0.140538 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3726  cysteine synthase B  35.66 
 
 		 300 aa  93.2  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0684  cysteine synthase B  36.36 
 
 		 294 aa  93.6  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2102  cysteine synthase B  34.27 
 
 		 296 aa  93.2  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37080  cysteine synthase B  34.03 
 
 		 299 aa  93.2  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2993  cysteine synthase B  37.01 
 
 		 300 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254167  hitchhiker  0.00110964 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1692  cysteine synthase B  35.17 
 
 		 300 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3697  cysteine synthase B  35.17 
 
 		 313 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.703798  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0990  cysteine synthase B  37.66 
 
 		 300 aa  92.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3252  cysteine synthase B  35.86 
 
 		 291 aa  92.8  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4219  cysteine synthase B  35.66 
 
 		 313 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0547109  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3163  cysteine synthase  39.86 
 
 		 354 aa  91.7  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0754  cysteine synthase B  35.66 
 
 		 300 aa  91.7  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1096  cysteine synthase  39.16 
 
 		 299 aa  89.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.365638 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  36.25 
 
 		 315 aa  89.4  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1285  cysteine synthase  37.06 
 
 		 300 aa  89.4  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2678  cysteine synthase  35.97 
 
 		 318 aa  88.2  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0380  cysteine synthase B  36 
 
 		 318 aa  87.8  8e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.5 
 
 		 307 aa  87.8  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1654  cysteine synthase B  33.1 
 
 		 299 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0738123  normal  0.776685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4064  cysteine synthase B  33.1 
 
 		 312 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1255  cysteine synthase B  33.1 
 
 		 312 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152363  hitchhiker  0.00382615 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0064  cysteine synthase B  31.94 
 
 		 295 aa  86.7  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  34.97 
 
 		 303 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0346  cysteine synthase B  35.95 
 
 		 318 aa  85.9  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  38.22 
 
 		 310 aa  85.9  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1306  cysteine synthase B  37.06 
 
 		 302 aa  85.9  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000334367  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  38.22 
 
 		 310 aa  85.9  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>