136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1058 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1058  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  142  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000643593  normal  0.078632 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  71.43 
 
 		 70 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  65.71 
 
 		 70 aa  100  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  68.18 
 
 		 75 aa  94.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  68.18 
 
 		 75 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  68.18 
 
 		 75 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  62.34 
 
 		 77 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2584  hypothetical protein  61.43 
 
 		 80 aa  89.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0247  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0975224  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.45 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19401  hypothetical protein  46.38 
 
 		 70 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.952724 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13201  hypothetical protein  43.48 
 
 		 70 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  50 
 
 		 331 aa  58.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1503  ThiS, thiamine-biosynthesis  46.38 
 
 		 72 aa  57  0.00000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  43.94 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  50 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  47.95 
 
 		 374 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1345  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2432  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  45.16 
 
 		 329 aa  53.9  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.129281  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1841  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.430269 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  42.42 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0726  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00139474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0841  ThiS, thiamine-biosynthesis  47.83 
 
 		 72 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  48.39 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16951  hypothetical protein  48.53 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.277619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1865  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0959115  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2136  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 73 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.85 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  43.28 
 
 		 98 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  43.28 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1179  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.94 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  46.97 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0788  sulfur carrier protein ThiS  41.79 
 
 		 67 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450844  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0597  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.06 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0654  thiamine biosynthesis protein ThiS  54.9 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0130451  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0792  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.16 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.464856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0642  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.16 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0618  sulfur carrier protein ThiS  41.54 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0777  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  50.4  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01842  sulfur carrier protein ThiS  45.45 
 
 		 66 aa  50.8  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.11 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0071  thiamine biosynthesis protein ThiS  49.06 
 
 		 162 aa  50.4  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.290426  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0895  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.03 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.31 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0801  sulfur carrier protein ThiS  40.3 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0697  sulfur carrier protein ThiS  40.3 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0641  sulfur carrier protein ThiS  40.3 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0808  sulfur carrier protein ThiS  40.3 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47601e-48 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0731  sulfur carrier protein ThiS  40.3 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4543  sulfur carrier protein ThiS  40.3 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.528402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0667  thiamine biosynthesis protein ThiS  52.94 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.20728e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0885  sulfur carrier protein ThiS  40.3 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164722  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1275  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.106306  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1823  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0647  sulfur carrier protein ThiS  40.3 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0641  sulfur carrier protein ThiS  40.3 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1095  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.33 
 
 		 68 aa  47.4  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.364292  normal  0.0606209 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1416  sulfur carrier protein ThiS  41.79 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  47.4  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2072  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.71 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.113816  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34640  sulfur carrier protein ThiS  37.1 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0439272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0666  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.71 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0877  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0304024  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14741  hypothetical protein  37.14 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.214043  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3944  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.13 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000530679  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0734  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.32 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1135  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.477207  normal  0.0493363 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14601  hypothetical protein  37.14 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0801  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3071  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.77 
 
 		 85 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1068  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.71 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.60648  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  51.11 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.08 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 211 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3747  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1369  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.78 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0915348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>