38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1204 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1204  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  313  5e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.259392  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0597  hypothetical protein  42.86 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.403415  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13991  hypothetical protein  42.86 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1506  hypothetical protein  43.48 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12421  hypothetical protein  43.48 
 
 		 141 aa  107  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16041  hypothetical protein  34.21 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10991  double-stranded beta-helix domain-containing protein  33.1 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13041  hypothetical protein  35.14 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12971  hypothetical protein  35.14 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.298883  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1225  hypothetical protein  34.23 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0594  hypothetical protein  30.77 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13891  hypothetical protein  30.77 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0998  hypothetical protein  29.93 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04261  hypothetical protein  29.17 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.648244  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1633  hypothetical protein  31.03 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2532  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.31 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16011  hypothetical protein  28.7 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0909  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3656  cupin 2, barrel  30.5 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110053  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1610  cupin 2, barrel  27.21 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000344419 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.46 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  32.03 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02199  hypothetical protein  27.45 
 
 		 139 aa  50.8  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1314  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.59 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000442476  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  31.73 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1250  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.73 
 
 		 193 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015051 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0909  hypothetical protein  35.14 
 
 		 125 aa  47.8  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0993672  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1726  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.53 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.680674  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1978  cupin 2 domain-containing protein  28.75 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.74 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3293  cupin 2 domain-containing protein  29.63 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.661006 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0868  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.59 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5021  cupin region  32.81 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00533136  normal  0.0498556 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  29.66 
 
 		 129 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.86 
 
 		 113 aa  42  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5708  cupin 2 domain-containing protein  36.05 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0831  hypothetical protein  28.75 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.668197  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2224  hypothetical protein  29.31 
 
 		 166 aa  40.8  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>