More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0641 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_06791  glutamyl-tRNA synthetase  76.42 
 
 		 476 aa  758    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04741  glutamyl-tRNA synthetase  62.74 
 
 		 492 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.633658  normal  0.679149 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1806  glutamyl-tRNA synthetase  62.32 
 
 		 476 aa  637    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1719  glutamyl-tRNA synthetase  78.99 
 
 		 477 aa  779    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0641  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 477 aa  974    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05291  glutamyl-tRNA synthetase  61.68 
 
 		 492 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0717874 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  63.94 
 
 		 481 aa  615  1e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 		 881 aa  582  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  59.21 
 
 		 481 aa  575  1.0000000000000001e-163  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000448328  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  58.63 
 
 		 481 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  58.66 
 
 		 481 aa  570  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3196  glutamyl-tRNA synthetase  59.29 
 
 		 482 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  56.96 
 
 		 483 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  56.76 
 
 		 483 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04981  glutamyl-tRNA synthetase  52.11 
 
 		 476 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.475242  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0473  glutamyl-tRNA synthetase  51.58 
 
 		 479 aa  531  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.138189  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05281  glutamyl-tRNA synthetase  51.48 
 
 		 476 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05371  glutamyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 		 493 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 		 485 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 488 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 482 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 466 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 472 aa  324  2e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 466 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 485 aa  325  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 491 aa  323  3e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 484 aa  323  4e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  36.6 
 
 		 479 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 477 aa  320  3e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 471 aa  319  6e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 494 aa  319  7e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 485 aa  319  7.999999999999999e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 		 470 aa  317  2e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 484 aa  317  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 484 aa  317  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 480 aa  317  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 485 aa  316  7e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 465 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 486 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 465 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 466 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 		 490 aa  311  1e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 469 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 490 aa  310  2.9999999999999997e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 490 aa  310  2.9999999999999997e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 469 aa  310  5e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 483 aa  308  1.0000000000000001e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 485 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 491 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 464 aa  307  3e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 468 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1793  glutamyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 		 484 aa  306  4.0000000000000004e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0101164  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 467 aa  306  6e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 470 aa  306  7e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 467 aa  306  7e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 470 aa  305  9.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 		 491 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 		 485 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 		 485 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 		 485 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 		 485 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 		 485 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 		 485 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 471 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 467 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 488 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 466 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 464 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0161  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 498 aa  303  4.0000000000000003e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0361508  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 467 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 501 aa  302  9e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 		 491 aa  302  9e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 490 aa  301  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 472 aa  300  3e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 469 aa  300  4e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 474 aa  300  5e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 475 aa  298  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 		 488 aa  298  1e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 		 469 aa  298  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 470 aa  297  3e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 472 aa  297  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0113  glutamyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 484 aa  296  4e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000311302  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 474 aa  296  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 474 aa  296  5e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 470 aa  295  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 467 aa  294  2e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1201  glutamyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 		 501 aa  295  2e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000196599  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 		 488 aa  295  2e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5146  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 474 aa  293  7e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.883623  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 475 aa  292  9e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 468 aa  291  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 466 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4681  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 474 aa  292  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 481 aa  291  2e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2906  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 469 aa  291  3e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000836575  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 473 aa  290  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 		 473 aa  290  4e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2196  glutamyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 463 aa  290  4e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000179412  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1191  glutamyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 		 471 aa  290  6e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>