More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2198 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  51.16 
 
 
699 aa  711  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  1.39334e-08 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2102  elongation factor G  50.57 
 
 
705 aa  697  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.990923  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0273  elongation factor G  51.59 
 
 
700 aa  716  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823209  normal  0.369004 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0047  elongation factor G  51.44 
 
 
700 aa  692  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  2.9839e-09  decreased coverage  6.96868e-24 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3863  elongation factor G  52.81 
 
 
700 aa  723  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2192  elongation factor G  50.43 
 
 
705 aa  695  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.857068  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0356  elongation factor G  55.47 
 
 
691 aa  781  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0324  elongation factor G  51.59 
 
 
700 aa  716  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00564924  normal  0.0493558 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2198  elongation factor G  100 
 
 
694 aa  1427  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  5.86447e-06  hitchhiker  7.26448e-06 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2215  elongation factor G  54.59 
 
 
691 aa  769  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226947  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4752  elongation factor G  51.12 
 
 
714 aa  721  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0168923  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3385  elongation factor G  50.36 
 
 
703 aa  705  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3621  elongation factor G  54.68 
 
 
704 aa  753  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.94361e-06  hitchhiker  0.000724432 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0373  elongation factor G  54.68 
 
 
704 aa  753  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  4.19107e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0277  elongation factor G  52.53 
 
 
702 aa  723  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  1.12388e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  51.24 
 
 
689 aa  709  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0803  elongation factor G  54.47 
 
 
692 aa  766  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.468644  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1351  elongation factor G  54.6 
 
 
691 aa  751  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.289583  normal  0.0183349 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2843  elongation factor G  51.66 
 
 
700 aa  718  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52933  normal  0.221266 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3714  elongation factor G  54.68 
 
 
704 aa  753  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.97299e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3814  elongation factor G  54.39 
 
 
704 aa  741  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.133333  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3643  elongation factor G  54.39 
 
 
704 aa  741  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  6.61479e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  51.75 
 
 
692 aa  714  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  51.31 
 
 
697 aa  716  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02562  elongation factor G  82.59 
 
 
695 aa  1197  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000812277  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3642  elongation factor G  54.39 
 
 
704 aa  741  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.156207  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3751  elongation factor G  54.39 
 
 
704 aa  741  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.491712  normal  0.0846164 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3716  elongation factor G  54.39 
 
 
704 aa  741  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0927216  normal  0.0969109 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0753  elongation factor G  51.84 
 
 
713 aa  710  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.026843  normal  0.074502 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3670  elongation factor G  55.36 
 
 
690 aa  778  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  51.74 
 
 
692 aa  720  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2120  elongation factor G  54.26 
 
 
691 aa  777  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.584312  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  50.44 
 
 
691 aa  703  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  1.12943e-07  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3300  elongation factor G  51.19 
 
 
723 aa  712  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00108075  hitchhiker  0.00222959 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3647  elongation factor G  52.02 
 
 
700 aa  717  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  6.46434e-05  hitchhiker  4.15866e-10 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4484  elongation factor G  52.5 
 
 
700 aa  699  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.707132  normal  0.129741 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3684  elongation factor G  50.22 
 
 
706 aa  705  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312611  hitchhiker  0.00286415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0481  elongation factor G  51.7 
 
 
714 aa  727  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0301247  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  51.02 
 
 
692 aa  695  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.76822e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00055  elongation factor G  53.89 
 
 
699 aa  724  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  51.23 
 
 
699 aa  729  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1676  elongation factor G  55.26 
 
 
691 aa  775  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377788  hitchhiker  0.000311159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2733  translation elongation factor G  55.52 
 
 
691 aa  774  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.167208 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  52.44 
 
 
692 aa  724  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  51.79 
 
 
691 aa  707  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3919  elongation factor G  52.53 
 
 
702 aa  723  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.96872e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  52.29 
 
 
691 aa  720  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  51.24 
 
 
697 aa  716  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  51.45 
 
 
692 aa  702  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  5.83321e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1953  elongation factor G  54.29 
 
 
694 aa  733  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0878239  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0820  elongation factor G  89.6 
 
 
697 aa  1291  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  3.94199e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0193  elongation factor G  52.31 
 
 
698 aa  716  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.38252e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0684  translation elongation factor G  51.36 
 
 
700 aa  714  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3223  elongation factor G  52.31 
 
 
730 aa  723  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0834  elongation factor G  52.79 
 
 
706 aa  710  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.757744  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03369  elongation factor G  85.04 
 
 
695 aa  1234  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3536  elongation factor G  54.68 
 
 
704 aa  753  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.52954e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3809  elongation factor G  54.68 
 
 
704 aa  753  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.25417e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2159  elongation factor G  54.6 
 
 
691 aa  773  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.894134 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3675  elongation factor G  52.53 
 
 
702 aa  723  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  1.79981e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  51.23 
 
 
699 aa  731  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.03691e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0246  elongation factor G  51.59 
 
 
700 aa  715  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000177676  normal  0.29158 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2307  translation elongation factor G  53.89 
 
 
700 aa  728  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0388  elongation factor G  53.53 
 
 
702 aa  732  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00665506  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0855  elongation factor G  89.6 
 
 
697 aa  1290  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0009948  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0197  elongation factor G  52.31 
 
 
698 aa  716  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0142343  unclonable  1.82182e-05 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0273  elongation factor G  53.31 
 
 
705 aa  729  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6052  elongation factor G  50.58 
 
 
698 aa  704  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1799  elongation factor G  95.24 
 
 
694 aa  1369  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000204091  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0181  elongation factor G  52.02 
 
 
698 aa  701  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  3.44622e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4549  elongation factor G  52.66 
 
 
704 aa  731  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  4.85563e-08  normal  0.0800773 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2537  translation elongation factor G  50.57 
 
 
701 aa  701  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4320  elongation factor G  52.17 
 
 
698 aa  693  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  5.82121e-06  unclonable  2.47136e-10 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2409  elongation factor G  96.39 
 
 
696 aa  1382  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  7.20128e-06  hitchhiker  8.20155e-06 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4279  translation elongation factor G  50.07 
 
 
697 aa  707  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  6.2878e-06  unclonable  9.8696e-12 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0559  translation elongation factor G  50.79 
 
 
700 aa  696  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.347154  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  52.05 
 
 
690 aa  707  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  8.16454e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  50.58 
 
 
689 aa  711  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  4.50896e-07  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  50.73 
 
 
691 aa  691  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0584  translation elongation factor G  51.94 
 
 
699 aa  717  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19852  normal  0.151402 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2777  translation elongation factor G  52.58 
 
 
689 aa  705  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0295771  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20910  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  50.57 
 
 
702 aa  702  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.357835  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1145  elongation factor G  50.57 
 
 
706 aa  710  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0513047  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  51.17 
 
 
691 aa  694  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0796  elongation factor G  75.36 
 
 
695 aa  1124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0475216  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1612  translation elongation factor G  51.2 
 
 
715 aa  719  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0923  elongation factor G  52.14 
 
 
705 aa  713  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.345609  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6617  translation elongation factor G  51.8 
 
 
700 aa  721  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0597  elongation factor G  50.71 
 
 
704 aa  705  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0295214  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  52.33 
 
 
692 aa  723  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3828  elongation factor G  54.39 
 
 
704 aa  734  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000816604  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0318  elongation factor G  54.24 
 
 
704 aa  738  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000130884  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  51.46 
 
 
689 aa  708  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4007  elongation factor G  54.24 
 
 
704 aa  735  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  2.80538e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0320  translation elongation factor G  53.03 
 
 
699 aa  716  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  4.39347e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3467  translation elongation factor G  52.44 
 
 
701 aa  723  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0283568  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2662  translation elongation factor G  51.44 
 
 
700 aa  715  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1833  translation elongation factor G  51.46 
 
 
693 aa  702  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.03063e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1182  translation elongation factor G  51.23 
 
 
699 aa  717  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.0924393 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2172  translation elongation factor G  52.67 
 
 
698 aa  723  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.063609  normal  0.792928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>