More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0755 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03191  elongation factor EF-2  58.22 
 
 
704 aa  824    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000806084  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0373  translation elongation factor G  58.22 
 
 
704 aa  824    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000927424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  59.15 
 
 
692 aa  868    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4111  elongation factor G  56.8 
 
 
703 aa  823    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  55.6 
 
 
693 aa  806    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  57.59 
 
 
698 aa  827    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0016  elongation factor G  61.51 
 
 
691 aa  901    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3022  elongation factor G  57.95 
 
 
703 aa  831    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000530326  decreased coverage  0.00189636 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0804  elongation factor G  56.6 
 
 
700 aa  797    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.0692379 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  60.43 
 
 
692 aa  875    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4765  translation elongation factor G  56.9 
 
 
699 aa  806    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17337  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  56.52 
 
 
691 aa  827    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  57.93 
 
 
692 aa  834    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1236  elongation factor G  70.58 
 
 
694 aa  1003    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0596578  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  57.75 
 
 
698 aa  807    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0623  translation elongation factor G  56.66 
 
 
701 aa  816    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  60.43 
 
 
692 aa  875    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  60.43 
 
 
692 aa  875    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl622  elongation factor G  57.43 
 
 
689 aa  822    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  60.57 
 
 
692 aa  875    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2252  elongation factor G  57.37 
 
 
704 aa  808    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2635  elongation factor G  57.1 
 
 
700 aa  822    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00747031  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  58.2 
 
 
694 aa  825    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  58.2 
 
 
694 aa  825    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4551  elongation factor G  56.66 
 
 
701 aa  817    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0946111 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0316  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  57.79 
 
 
697 aa  812    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000146619  hitchhiker  0.000265017 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  56.94 
 
 
704 aa  819    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3183  elongation factor G  58.66 
 
 
702 aa  836    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0250795  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5535  elongation factor G  58.58 
 
 
701 aa  820    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.873781  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0161  elongation factor G  61.29 
 
 
690 aa  880    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.165931  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  56.31 
 
 
696 aa  810    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000137892  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1361  elongation factor G  68.18 
 
 
690 aa  1006    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.472174 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1105  elongation factor G  57.37 
 
 
704 aa  808    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00766491  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3779  elongation factor G  57.1 
 
 
700 aa  822    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00287392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  58.16 
 
 
697 aa  819    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5082  elongation factor G  56.37 
 
 
701 aa  813    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000061463  normal  0.350289 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1708  elongation factor G  87.31 
 
 
705 aa  1261    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  57.26 
 
 
692 aa  833    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3444  elongation factor G  57.02 
 
 
700 aa  815    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000177525  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5860  elongation factor G  57.65 
 
 
701 aa  806    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.176276  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0177  elongation factor G  55.18 
 
 
704 aa  802    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000263654  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1854  elongation factor G  54.89 
 
 
704 aa  805    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000767386  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  59.29 
 
 
692 aa  869    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0292  translation elongation factor G  57.16 
 
 
700 aa  810    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000300154  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  60.43 
 
 
692 aa  875    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  56.17 
 
 
696 aa  811    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0153  elongation factor G  56.45 
 
 
689 aa  817    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2691  elongation factor G  68.46 
 
 
692 aa  998    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  59.83 
 
 
692 aa  880    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0756  elongation factor G  57.37 
 
 
704 aa  806    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3071  elongation factor G  57.1 
 
 
700 aa  822    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153442  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  58.87 
 
 
697 aa  858    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0579  elongation factor G  59.66 
 
 
698 aa  860    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179959  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2292  elongation factor G  68.18 
 
 
690 aa  1015    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1246  elongation factor G  65.4 
 
 
690 aa  971    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0687  translation elongation factor G  58.1 
 
 
692 aa  838    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.000000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0961  elongation factor G  60.76 
 
 
690 aa  884    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0577  elongation factor G  80.65 
 
 
706 aa  1174    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3798  elongation factor G  57.81 
 
 
700 aa  807    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000136641  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3451  elongation factor G  67.19 
 
 
690 aa  1000    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  55.95 
 
 
697 aa  812    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  57.69 
 
 
700 aa  820    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4287  elongation factor G  56.17 
 
 
704 aa  800    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0311  elongation factor G  57.1 
 
 
700 aa  814    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000859438  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3187  elongation factor G  68.88 
 
 
690 aa  1025    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1542  elongation factor G  68.46 
 
 
690 aa  1010    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3325  elongation factor G  58.38 
 
 
703 aa  834    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.888468  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5930  elongation factor G  57.87 
 
 
702 aa  812    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955652  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  56.17 
 
 
697 aa  826    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0241  elongation factor G  79.8 
 
 
706 aa  1154    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449093  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2821  elongation factor G  66.34 
 
 
697 aa  986    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.114421 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1916  elongation factor G  57.53 
 
 
747 aa  803    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2762  elongation factor G  57.02 
 
 
700 aa  818    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0608809  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0986  elongation factor G  56.33 
 
 
701 aa  816    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.798274  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2158  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  57.38 
 
 
715 aa  816    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.959287  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0602  translation elongation factor G  56.96 
 
 
701 aa  798    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000132615  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1681  elongation factor G  70.16 
 
 
696 aa  1009    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562102  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2717  elongation factor G  56.74 
 
 
688 aa  827    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2403  elongation factor G  56.74 
 
 
688 aa  827    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149937  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1645  elongation factor G  57.1 
 
 
700 aa  800    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562984  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0196  elongation factor G  57.18 
 
 
698 aa  808    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000160004  hitchhiker  0.000000014201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0191  elongation factor G  57.18 
 
 
698 aa  808    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0652513  decreased coverage  0.000543209 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0145  elongation factor G  56.76 
 
 
698 aa  801    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000355615  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1798  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  69.87 
 
 
691 aa  1037    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.287581  normal  0.0715825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0264  elongation factor G  56.88 
 
 
700 aa  814    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2576  elongation factor G  57.22 
 
 
703 aa  801    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.275425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08820  elongation factor G  57.02 
 
 
706 aa  816    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.569469  normal  0.0264606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37710  elongation factor G  57.47 
 
 
702 aa  829    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1314  elongation factor G  56.66 
 
 
702 aa  817    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00915512  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  56.03 
 
 
698 aa  810    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0189  elongation factor G  57.33 
 
 
703 aa  803    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  56.94 
 
 
693 aa  823    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2980  elongation factor G  57.28 
 
 
713 aa  821    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6565  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0345  elongation factor G  57.02 
 
 
700 aa  819    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2528  elongation factor G  57.65 
 
 
703 aa  806    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.584874  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  58.44 
 
 
692 aa  841    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0196  elongation factor G  57.47 
 
 
698 aa  814    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00867813  hitchhiker  0.0000000723027 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0303  elongation factor G  57.33 
 
 
700 aa  828    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383958 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  56.8 
 
 
691 aa  835    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  58.72 
 
 
692 aa  864    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>