44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1438 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1438  major facilitator transporter  100 
 
 		 415 aa  829    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0981  hypothetical protein  73.12 
 
 		 415 aa  623  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2963  major facilitator superfamily MFS_1  57.5 
 
 		 421 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121972  normal  0.284618 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3505  major facilitator transporter  53.55 
 
 		 412 aa  425  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1824  major facilitator transporter  56.08 
 
 		 415 aa  420  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1433  transporter, MFS superfamily  48.59 
 
 		 420 aa  372  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811642  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1261  major facilitator transporter  49.26 
 
 		 406 aa  364  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0306  major facilitator transporter  49.03 
 
 		 409 aa  336  5e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.338859  normal  0.158126 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 425 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  27.5 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  25.82 
 
 		 407 aa  116  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523123  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000504378  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 406 aa  110  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0005  major facilitator transporter  21.12 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0753564  normal  0.228788 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2076  major facilitator superfamily MFS_1  22.43 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  20.59 
 
 		 388 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  20.59 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  20.86 
 
 		 393 aa  52.8  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  21.56 
 
 		 505 aa  51.2  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0563  major facilitator transporter  21.8 
 
 		 425 aa  49.7  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  22.73 
 
 		 433 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  23.16 
 
 		 398 aa  47.4  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0534  major facilitator transporter  28.66 
 
 		 391 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  20.51 
 
 		 394 aa  46.6  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  20.65 
 
 		 420 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  21.93 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  21.05 
 
 		 457 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0776  major facilitator transporter  25 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1407  major facilitator transporter  21.32 
 
 		 447 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03875  Nitrate/nitrite transporter  20.95 
 
 		 431 aa  44.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  23.11 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  20.7 
 
 		 457 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  20.7 
 
 		 457 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  23.6 
 
 		 429 aa  44.3  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  21.37 
 
 		 423 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  21.19 
 
 		 423 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>