193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2109 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2109  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  567  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  39.79 
 
 
302 aa  186  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.19 
 
 
302 aa  181  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.11 
 
 
300 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.01 
 
 
295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  40.79 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.79 
 
 
302 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0587  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.06 
 
 
300 aa  168  8e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.770016  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  40.07 
 
 
310 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  35.79 
 
 
297 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  35.52 
 
 
297 aa  163  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  36.14 
 
 
300 aa  162  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  36.11 
 
 
303 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  36.11 
 
 
303 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  32.97 
 
 
294 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  36.11 
 
 
303 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  36.11 
 
 
303 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  36.11 
 
 
303 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  35.76 
 
 
309 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  35.76 
 
 
303 aa  156  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  35.42 
 
 
303 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  35.42 
 
 
303 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  36.43 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.14 
 
 
302 aa  153  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.67 
 
 
307 aa  153  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  35.07 
 
 
303 aa  153  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.78 
 
 
305 aa  152  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  32.26 
 
 
294 aa  152  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  32.26 
 
 
294 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  31.9 
 
 
294 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  31.9 
 
 
294 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  35.34 
 
 
303 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.89 
 
 
293 aa  150  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.918526  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2028  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.45 
 
 
316 aa  149  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  37.31 
 
 
305 aa  149  7e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2512  hypothetical protein  33.33 
 
 
295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0135792  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  30.95 
 
 
296 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.82 
 
 
298 aa  145  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2952  hypothetical protein  29.47 
 
 
295 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0338649  hitchhiker  0.0000000562298 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  40.32 
 
 
316 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2379  hypothetical protein  29.93 
 
 
295 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.77 
 
 
307 aa  133  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1219  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.08 
 
 
288 aa  124  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0748  hypothetical protein  32.97 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0063  hypothetical protein  33.56 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.51 
 
 
300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.618176 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.65 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.841785  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  28.17 
 
 
296 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1991  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.16 
 
 
300 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3455  hypothetical protein  31.33 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 
284 aa  108  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.58 
 
 
305 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557636 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1257  hypothetical protein  35 
 
 
277 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2519  hypothetical protein  40.69 
 
 
318 aa  106  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.561835 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2001  hypothetical protein  31.3 
 
 
283 aa  102  8e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.58 
 
 
304 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.484087 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1038  hypothetical protein  29.62 
 
 
273 aa  92.8  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000348344  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1137  hypothetical protein  33.6 
 
 
285 aa  87.8  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.893174  hitchhiker  0.00000000116999 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.01 
 
 
296 aa  87  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.08 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0097  hypothetical protein  31.35 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.35 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0861  hypothetical protein  25.52 
 
 
294 aa  77  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1136  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.65 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0816  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.47 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0721  hypothetical protein  31.84 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  25.63 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0089  hypothetical protein  33.33 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.893408  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0737  hypothetical protein  26.71 
 
 
281 aa  69.3  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0689  hypothetical protein  26.71 
 
 
281 aa  69.3  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.164127  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.74 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0667  hypothetical protein  31.18 
 
 
319 aa  68.9  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.522504 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0010  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000132585 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.16 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 
284 aa  67  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2973  hypothetical protein  27.35 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2413  hypothetical protein  26.1 
 
 
281 aa  67  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.163379 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0090  hypothetical protein  23.79 
 
 
297 aa  64.7  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2339  hypothetical protein  28.62 
 
 
337 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0842181  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0009  hypothetical protein  29.84 
 
 
304 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7770  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.92 
 
 
317 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1219  hypothetical protein  27.41 
 
 
306 aa  59.3  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.465362  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.62 
 
 
359 aa  57.4  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.902863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5965  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.88 
 
 
328 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.53 
 
 
293 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.815288  normal  0.766233 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.46 
 
 
299 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  25.42 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0968  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.5 
 
 
314 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  27.41 
 
 
314 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3346  hypothetical protein  23.78 
 
 
331 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  24.66 
 
 
308 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  27.78 
 
 
288 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  27.78 
 
 
288 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.35 
 
 
283 aa  53.9  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0997  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 
315 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  28.5 
 
 
316 aa  53.5  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.75 
 
 
297 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  29.02 
 
 
319 aa  53.1  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.44 
 
 
307 aa  52.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  27.94 
 
 
301 aa  52  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>