More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1579 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  100 
 
 		 184 aa  365  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  45.7 
 
 		 192 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  40.13 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  38.95 
 
 		 190 aa  122  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  39.25 
 
 		 181 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  41.03 
 
 		 208 aa  118  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  40.56 
 
 		 198 aa  117  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  40.72 
 
 		 192 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  41.56 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  41.67 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  42.28 
 
 		 192 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  41.03 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  41.03 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  41.03 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  41.03 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  41.03 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  41.03 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  41.03 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  41.61 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0764  GrpE protein  36.57 
 
 		 187 aa  111  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  39.61 
 
 		 226 aa  111  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  38.89 
 
 		 189 aa  111  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0732  GrpE protein  39.05 
 
 		 178 aa  110  9e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149267  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  38.04 
 
 		 210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  46.56 
 
 		 178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  41.56 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  40.12 
 
 		 225 aa  107  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  37.82 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  38.82 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  36 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  42.11 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  40.52 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  33.88 
 
 		 181 aa  105  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  37.28 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1004  heat shock protein GrpE  38.82 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.324391 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  35.76 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  36.21 
 
 		 204 aa  101  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  38.85 
 
 		 199 aa  101  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1040  heat shock protein GrpE  40.14 
 
 		 184 aa  100  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  35.39 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  34.25 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  37.93 
 
 		 244 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  35.86 
 
 		 210 aa  99  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  34.64 
 
 		 208 aa  97.8  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  34.64 
 
 		 208 aa  97.8  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  34.22 
 
 		 210 aa  97.1  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  34.31 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  31.94 
 
 		 192 aa  97.1  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  35.09 
 
 		 186 aa  97.1  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  38.61 
 
 		 181 aa  96.3  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  39.42 
 
 		 189 aa  96.3  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  37.42 
 
 		 225 aa  96.3  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  32.91 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  37.68 
 
 		 200 aa  95.9  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  34.5 
 
 		 188 aa  95.5  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 189 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  37.5 
 
 		 231 aa  95.5  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  35.76 
 
 		 199 aa  95.5  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  35.37 
 
 		 190 aa  95.1  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  34.55 
 
 		 184 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0612  co-chaperone GrpE  36.77 
 
 		 198 aa  95.1  6e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1605  GrpE protein  37.82 
 
 		 162 aa  94.4  8e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0303276  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  35.1 
 
 		 199 aa  94.4  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 186 aa  94.4  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  35.71 
 
 		 210 aa  94.4  9e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  36.36 
 
 		 189 aa  94.4  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  34.3 
 
 		 194 aa  94  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  34.62 
 
 		 260 aa  94  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  34.38 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  33.96 
 
 		 194 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 185 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  30.06 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  34.39 
 
 		 190 aa  93.6  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4329  GrpE protein  36.81 
 
 		 242 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.134987  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  37.82 
 
 		 221 aa  93.2  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  35.81 
 
 		 259 aa  92.8  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  35.81 
 
 		 259 aa  92.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 185 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  34.52 
 
 		 184 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  32.4 
 
 		 204 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  38.06 
 
 		 224 aa  92.8  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0752  GrpE protein  36.31 
 
 		 184 aa  92.4  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  0.250608 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  34.68 
 
 		 196 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  35.85 
 
 		 195 aa  92.4  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  34.39 
 
 		 282 aa  92.4  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  34.68 
 
 		 197 aa  92  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  34.68 
 
 		 197 aa  92  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4475  GrpE protein  37.14 
 
 		 224 aa  92  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323495  normal  0.188028 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  33.13 
 
 		 225 aa  92  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  37.58 
 
 		 193 aa  92  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  30 
 
 		 191 aa  92  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  34.68 
 
 		 197 aa  92  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  34.68 
 
 		 196 aa  92  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  34.68 
 
 		 197 aa  92  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  38.78 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  34.68 
 
 		 197 aa  92  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  34.68 
 
 		 197 aa  92  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  35.09 
 
 		 197 aa  92  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  36.18 
 
 		 186 aa  91.7  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 230 aa  91.7  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>