248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0016 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0016  redoxin domain-containing protein  100 
 
 		 184 aa  382  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5199  redoxin domain-containing protein  67.42 
 
 		 179 aa  261  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6651  Redoxin domain protein  66.47 
 
 		 189 aa  238  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.377378  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2781  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  62.57 
 
 		 182 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1423  redoxin domain-containing protein  62.57 
 
 		 182 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.179376  normal  0.109109 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3473  hypothetical protein  58.86 
 
 		 179 aa  233  9e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2381  peroxiredoxin  61.49 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3596  redoxin  57.8 
 
 		 181 aa  232  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.723632 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1377  redoxin domain-containing protein  58.89 
 
 		 188 aa  231  6e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3040  redoxin domain-containing protein  62.94 
 
 		 176 aa  227  8e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.825504  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08311  peroxiredoxin  60.59 
 
 		 190 aa  221  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1324  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant  56.59 
 
 		 190 aa  220  7e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0162  redoxin  58.7 
 
 		 189 aa  219  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.648171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1176  putative peroxiredoxin  55.11 
 
 		 175 aa  218  5e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0424776  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1368  redoxin domain-containing protein  59.52 
 
 		 175 aa  212  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376833 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1596  Peroxiredoxin  57.4 
 
 		 190 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.238249 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3890  peroxiredoxin  55.23 
 
 		 174 aa  209  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1893  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  54.97 
 
 		 175 aa  204  8e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248351  normal  0.171971 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22388  peroxiredoxin  49.73 
 
 		 233 aa  168  4e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  45.25 
 
 		 243 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  45.25 
 
 		 243 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2175  Redoxin domain protein  45.76 
 
 		 245 aa  161  5.0000000000000005e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1796  glutaredoxin family protein  46.2 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193557  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4981  glutaredoxin-like region  45.35 
 
 		 251 aa  157  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0537  glutaredoxin-family domain protein  45 
 
 		 247 aa  156  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148652  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0367  AhpC/TSA family/glutaredoxin domain protein  45 
 
 		 247 aa  156  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000740319  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  42.86 
 
 		 245 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4889  thioredoxin reductase  45.98 
 
 		 243 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.0936024 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1689  glutaredoxin family protein  49.14 
 
 		 248 aa  154  8e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  44.25 
 
 		 247 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3472  glutaredoxin family protein  46.51 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.99974  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  42.31 
 
 		 238 aa  150  8e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4452  glutaredoxin-like region  45.83 
 
 		 243 aa  150  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3338  glutaredoxin family protein  44.44 
 
 		 247 aa  150  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280994  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002319  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  43.86 
 
 		 242 aa  149  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  43.27 
 
 		 247 aa  148  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2713  hybrid peroxiredoxin (thioredoxin reductase)  43.27 
 
 		 242 aa  146  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  40.78 
 
 		 242 aa  145  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1224  glutaredoxin family protein  44.19 
 
 		 248 aa  145  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.59398  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2464  glutaredoxin family protein  44.19 
 
 		 248 aa  145  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282108 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00036  glutaredoxin  43.27 
 
 		 242 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0683  redoxin domain-containing protein  48.32 
 
 		 162 aa  145  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.804383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0126  glutaredoxin-family domain protein  45.03 
 
 		 243 aa  144  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.803703  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  43.27 
 
 		 243 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  43.27 
 
 		 243 aa  142  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  43.27 
 
 		 243 aa  142  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  43.27 
 
 		 243 aa  142  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  41.34 
 
 		 246 aa  141  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  43.86 
 
 		 249 aa  141  7e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3122  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.35 
 
 		 168 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.92238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0173  redoxin domain-containing protein  46.9 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136902  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1130  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.86 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0913955  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  43.6 
 
 		 249 aa  133  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0187  Redoxin domain protein  43.67 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000633793  normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2718  Redoxin domain protein  48.37 
 
 		 166 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1905  redoxin domain-containing protein  50.81 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441559  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3464  Redoxin domain protein  50 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000691326 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2667  redoxin domain-containing protein  48.1 
 
 		 169 aa  129  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000181352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4903  Redoxin domain protein  44.94 
 
 		 168 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.183806  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0141  anti-oxidant AhpCTSA family protein  49.58 
 
 		 157 aa  128  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3083  Redoxin domain protein  47.06 
 
 		 166 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0388194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2973  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.4 
 
 		 168 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00621825  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0492  type 2 peroxiredoxin AhpC/TSAfamily  50 
 
 		 167 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000163064  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2838  type 2 peroxiredoxin protein  45.75 
 
 		 166 aa  128  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.15733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0469  redoxin domain-containing protein  44.94 
 
 		 168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0173332  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00160  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  44.16 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0494  redoxin domain-containing protein  44.94 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2830  redoxin domain-containing protein  45.57 
 
 		 168 aa  125  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000266084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0213  redoxin domain-containing protein  41.42 
 
 		 168 aa  124  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3544  anti-oxidant AhpCTSA family protein  44.94 
 
 		 168 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3519  anti-oxidant AhpCTSA family protein  44.94 
 
 		 168 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3239  AhpC/TSA family protein  44.94 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3433  AhpC/TSA-family protein  43.04 
 
 		 169 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0313282  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1324  AhpC/TSA family protein  44.94 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2544  AhpC/TSA family protein  44.94 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5126  Redoxin domain protein  38.96 
 
 		 162 aa  123  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3538  AhpC/TSA family protein  44.94 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3651  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.67 
 
 		 168 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000135148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0266  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.51 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0083  redoxin  43.67 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000103454  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2670  redoxin domain-containing protein  43.33 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0565  redoxin domain-containing protein  43.67 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0157246  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0465  AhpC/TSA family protein  44.94 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.490707  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0536  redoxin domain-containing protein  43.67 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397441  normal  0.710427 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0751  redoxin  44.37 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3989  redoxin domain-containing protein  46.1 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000343004 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1124  AhpC/TSA family protein  44.3 
 
 		 185 aa  122  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4640  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.66 
 
 		 158 aa  121  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3541  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.85 
 
 		 157 aa  121  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.29568  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0283  Redoxin domain protein  42.21 
 
 		 168 aa  121  7e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00098707  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0288  redoxin domain-containing protein  42.21 
 
 		 185 aa  120  8e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000039073 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3814  redoxin domain-containing protein  42.96 
 
 		 157 aa  120  9e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.632392  normal  0.0206857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3905  redoxin domain-containing protein  42.96 
 
 		 157 aa  120  9e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.105906  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4020  redoxin domain-containing protein  42.96 
 
 		 157 aa  120  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4137  Redoxin domain protein  42.28 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.797955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4209  redoxin domain-containing protein  42.28 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0205646  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3513  anti-oxidant AhpCTSA family protein  50.46 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0348  redoxin domain-containing protein  42.21 
 
 		 168 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.828163  decreased coverage  0.000328891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1274  redoxin domain-containing protein  43.21 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4341  redoxin domain-containing protein  42.28 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000616907  normal  0.618648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>