101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38250 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_38250  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 
280 aa  555  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201502  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3207  putative F420-dependent oxidoreductase  61.48 
 
 
272 aa  332  3e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1512  hypothetical protein  61.87 
 
 
279 aa  325  5e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00633715  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1067  hypothetical protein  56.04 
 
 
283 aa  296  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1083  hypothetical protein  56.04 
 
 
283 aa  296  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377526  normal  0.11045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1094  hypothetical protein  56.04 
 
 
283 aa  296  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5006  hypothetical protein  58.43 
 
 
287 aa  291  7e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1367  hypothetical protein  54.95 
 
 
285 aa  291  8e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.134083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6698  hypothetical protein  56.55 
 
 
291 aa  290  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2385  putative F420-dependent oxidoreductase  59.71 
 
 
288 aa  290  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5005  hypothetical protein  52.78 
 
 
294 aa  279  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3680  putative F420-dependent oxidoreductase  55.56 
 
 
281 aa  277  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1368  hypothetical protein  55.11 
 
 
281 aa  276  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233326  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1068  hypothetical protein  57.48 
 
 
276 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1084  hypothetical protein  57.48 
 
 
276 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0372016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1095  hypothetical protein  57.48 
 
 
276 aa  275  5e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13500  hypothetical protein  54.3 
 
 
285 aa  270  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000277953  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0252  hypothetical protein  53.94 
 
 
290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0151  hypothetical protein  50.71 
 
 
283 aa  250  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4343  hypothetical protein  47.46 
 
 
288 aa  235  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0952  hypothetical protein  44.72 
 
 
285 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3932  hypothetical protein  45.45 
 
 
286 aa  218  8.999999999999998e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3854  hypothetical protein  45.8 
 
 
286 aa  216  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357835  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2620  hypothetical protein  46.62 
 
 
296 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5643  hypothetical protein  45.82 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2688  hypothetical protein  44.41 
 
 
286 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.566827  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1545  hypothetical protein  50 
 
 
301 aa  210  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000935429  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6257  hypothetical protein  44.44 
 
 
285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.949372  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  41.92 
 
 
334 aa  192  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3644  hypothetical protein  45.08 
 
 
307 aa  186  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4349  hypothetical protein  43.42 
 
 
324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  43.87 
 
 
304 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3965  hypothetical protein  43.77 
 
 
324 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0059  hypothetical protein  40.57 
 
 
303 aa  178  7e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0497  hypothetical protein  39.1 
 
 
303 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0508  hypothetical protein  39.1 
 
 
303 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0486  hypothetical protein  39.1 
 
 
303 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5428  hypothetical protein  38.64 
 
 
275 aa  142  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4154  hypothetical protein  36.43 
 
 
301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238248  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5686  hypothetical protein  34.3 
 
 
271 aa  109  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  26.76 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.11 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  27.31 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  27.8 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  26.25 
 
 
306 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  27.3 
 
 
335 aa  67.4  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  26.74 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  28.52 
 
 
346 aa  63.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  27.46 
 
 
344 aa  62.4  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  25.84 
 
 
327 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  29.66 
 
 
321 aa  58.9  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  25.41 
 
 
326 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  28.83 
 
 
318 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  26.78 
 
 
318 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  26.78 
 
 
318 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  26.78 
 
 
318 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  27.34 
 
 
317 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  24.92 
 
 
350 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  25.42 
 
 
318 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  24.92 
 
 
350 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  25.81 
 
 
359 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  25.42 
 
 
318 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.93 
 
 
334 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  31.19 
 
 
309 aa  49.7  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  25.83 
 
 
346 aa  49.3  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  27.27 
 
 
311 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  25.08 
 
 
360 aa  47  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.09 
 
 
344 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1874  luciferase family protein  35.96 
 
 
333 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1844  luciferase-like monooxygenase  35.96 
 
 
333 aa  46.6  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2016  luciferase family protein  35.96 
 
 
333 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2051  luciferase family protein  35.96 
 
 
333 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.25536 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1828  luciferase-like monooxygenase  35.96 
 
 
333 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2129  luciferase family protein  35.96 
 
 
333 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.758622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  27.45 
 
 
349 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  26.72 
 
 
314 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2453  luciferase family protein  27.76 
 
 
317 aa  45.8  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2096  luciferase family protein  34.83 
 
 
333 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.916034  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.6 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  23.89 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  23.89 
 
 
349 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2018  luciferase family protein  34.83 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1025  Luciferase-like monooxygenase  33.71 
 
 
340 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  26.84 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1515  luciferase family protein  32.18 
 
 
346 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.192461 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1878  luciferase family protein  34.83 
 
 
333 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1994  luciferase family oxidoreductase, group 1  35.44 
 
 
341 aa  43.5  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1595  luciferase-like monooxygenase  30.19 
 
 
385 aa  43.5  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.823817  normal  0.27132 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1533  flavin-dependent oxidoreductase  35.63 
 
 
349 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  28.08 
 
 
353 aa  43.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4047  luciferase family protein  28.41 
 
 
347 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  0.465581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6951  luciferase family protein  24.59 
 
 
322 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4190  luciferase family protein  33.33 
 
 
353 aa  43.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3731  luciferase-like protein  27.56 
 
 
318 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3861  luciferase family protein  34.48 
 
 
349 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3804  luciferase family protein  27.56 
 
 
318 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0754765 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3743  luciferase family protein  27.56 
 
 
318 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3291  luciferase family protein  33.71 
 
 
333 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3937  luciferase-like  33.33 
 
 
349 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.334928  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.36 
 
 
339 aa  42.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>