More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_19550 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  100 
 
 		 361 aa  727    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  52.09 
 
 		 369 aa  314  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  50.28 
 
 		 355 aa  271  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06160  serine/threonine protein phosphatase  44.44 
 
 		 361 aa  223  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  49.59 
 
 		 426 aa  209  8e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  46.28 
 
 		 540 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  46.15 
 
 		 441 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  45.08 
 
 		 247 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  45.31 
 
 		 472 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  44.17 
 
 		 463 aa  179  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  45.64 
 
 		 421 aa  178  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  44.13 
 
 		 463 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  41.98 
 
 		 449 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  45.97 
 
 		 469 aa  177  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  45.49 
 
 		 265 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  45.99 
 
 		 467 aa  173  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  41.39 
 
 		 478 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.98 
 
 		 482 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  42.68 
 
 		 505 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  42.56 
 
 		 474 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4818  protein serine/threonine phosphatase  42.57 
 
 		 259 aa  165  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  43.21 
 
 		 466 aa  165  9e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0025  protein serine/threonine phosphatase  44.78 
 
 		 474 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0922005  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  43.03 
 
 		 438 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1591  Phosphoprotein phosphatase  45.45 
 
 		 253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  43.35 
 
 		 478 aa  163  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  44.63 
 
 		 519 aa  161  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  43.29 
 
 		 514 aa  157  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  41.98 
 
 		 477 aa  157  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  43.36 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0035  protein serine/threonine phosphatase  53.85 
 
 		 687 aa  152  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  42.42 
 
 		 516 aa  152  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  42.42 
 
 		 517 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0019  protein serine/threonine phosphatases  41.99 
 
 		 491 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.678049  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6203  protein serine/threonine phosphatase  40 
 
 		 239 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00400248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.99 
 
 		 491 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308307  hitchhiker  0.00998453 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  41.15 
 
 		 479 aa  151  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0019  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.99 
 
 		 491 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.888724 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  40.66 
 
 		 507 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  41.39 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.46 
 
 		 241 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4426  protein serine/threonine phosphatase  43.4 
 
 		 364 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0345572  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  38.25 
 
 		 500 aa  149  7e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  33.1 
 
 		 554 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0022  protein serine/threonine phosphatase  43.04 
 
 		 511 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  36.33 
 
 		 564 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  33.59 
 
 		 394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  38.26 
 
 		 425 aa  139  7e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  40.91 
 
 		 462 aa  136  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  38.15 
 
 		 567 aa  135  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  35.19 
 
 		 395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.69 
 
 		 611 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  38.71 
 
 		 239 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.71 
 
 		 239 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  38.36 
 
 		 452 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  37.35 
 
 		 558 aa  129  9.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  38.79 
 
 		 323 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  32.72 
 
 		 597 aa  125  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  37.21 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  38.14 
 
 		 416 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  36.33 
 
 		 571 aa  123  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1325  protein serine/threonine phosphatase  37.83 
 
 		 258 aa  122  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.67 
 
 		 237 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  49.6 
 
 		 272 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  37.5 
 
 		 348 aa  119  6e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  37.61 
 
 		 519 aa  119  9e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  37.07 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  38.21 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1155  protein serine/threonine phosphatase  49.25 
 
 		 267 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  34.18 
 
 		 238 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  36.1 
 
 		 320 aa  116  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.39 
 
 		 247 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  39.66 
 
 		 267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  35.5 
 
 		 239 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1982  protein phosphatase 2C domain-containing protein  44.07 
 
 		 268 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  37.3 
 
 		 422 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  38.89 
 
 		 236 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.92 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2163  protein serine/threonine phosphatase  36.18 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269356 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1464  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.63 
 
 		 322 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279788  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3492  protein phosphatase 2C-like  36.07 
 
 		 248 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.492295  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  37.25 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2449  protein serine/threonine phosphatase  37.96 
 
 		 239 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.54391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20950  serine/threonine protein phosphatase, 2C-like protein  35.8 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0398622  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  32.11 
 
 		 258 aa  107  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  35.32 
 
 		 236 aa  106  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  36.02 
 
 		 386 aa  106  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2397  Phosphoprotein phosphatase  35.95 
 
 		 246 aa  106  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.33 
 
 		 243 aa  106  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  30.49 
 
 		 243 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  30.29 
 
 		 245 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4042  protein serine/threonine phosphatase  32.27 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  30.6 
 
 		 574 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  33.89 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  28.69 
 
 		 241 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  30.21 
 
 		 241 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  33.89 
 
 		 259 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  28.52 
 
 		 548 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1997  protein serine/threonine phosphatase  38.46 
 
 		 244 aa  102  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  37.13 
 
 		 234 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>