More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1892 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1892  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
321 aa  644    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1885  ornithine carbamoyltransferase  86.96 
 
 
323 aa  559  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0234789  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2155  ornithine carbamoyltransferase  68.73 
 
 
311 aa  423  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2837  ornithine carbamoyltransferase  66.23 
 
 
307 aa  399  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10311  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  65.69 
 
 
307 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2027  ornithine carbamoyltransferase  66.56 
 
 
322 aa  395  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  64.17 
 
 
315 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  65.69 
 
 
307 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  65.36 
 
 
307 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11674  ornithine carbamoyltransferase  65.47 
 
 
307 aa  388  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.25899e-16  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6073  ornithine carbamoyltransferase  62.54 
 
 
338 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3310  ornithine carbamoyltransferase  63.82 
 
 
307 aa  391  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00885285  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1331  ornithine carbamoyltransferase  63.31 
 
 
310 aa  382  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0593865  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25590  ornithine carbamoyltransferase  64.71 
 
 
309 aa  383  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2369  ornithine carbamoyltransferase  63.23 
 
 
330 aa  378  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.943792  normal  0.0136411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3066  ornithine carbamoyltransferase  64.52 
 
 
319 aa  376  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478337  normal  0.328556 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2399  ornithine carbamoyltransferase  63.46 
 
 
312 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21700  ornithine carbamoyltransferase  61.41 
 
 
327 aa  371  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.513987  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5452  ornithine carbamoyltransferase  63.19 
 
 
310 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3526  ornithine carbamoyltransferase  63.19 
 
 
307 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5467  ornithine carbamoyltransferase  60.39 
 
 
308 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974312  normal  0.0257666 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  61.06 
 
 
312 aa  372  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1115  ornithine carbamoyltransferase  58.71 
 
 
310 aa  367  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  63.82 
 
 
312 aa  365  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1645  ornithine carbamoyltransferase  61.94 
 
 
310 aa  363  2e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2472  ornithine carbamoyltransferase  60.66 
 
 
306 aa  363  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14380  ornithine carbamoyltransferase  63.4 
 
 
319 aa  361  8e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0812  ornithine carbamoyltransferase  58.03 
 
 
321 aa  357  9.999999999999999e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3157  ornithine carbamoyltransferase  62.09 
 
 
306 aa  356  1.9999999999999998e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3024  ornithine carbamoyltransferase  61.41 
 
 
314 aa  344  8.999999999999999e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22290  ornithine carbamoyltransferase  62.01 
 
 
314 aa  344  1e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.586584  normal  0.554108 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  57.65 
 
 
340 aa  334  1e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10130  ornithine carbamoyltransferase  54.75 
 
 
308 aa  333  3e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1500  ornithine carbamoyltransferase  53.72 
 
 
335 aa  325  7e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1501  ornithine carbamoyltransferase  53.07 
 
 
333 aa  316  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190622 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  56.07 
 
 
317 aa  310  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  52.96 
 
 
309 aa  309  4e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2339  ornithine carbamoyltransferase  51.79 
 
 
309 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.235287  hitchhiker  0.00582642 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  48.37 
 
 
305 aa  298  1e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  49.32 
 
 
306 aa  292  5e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 
305 aa  292  6e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3875  ornithine carbamoyltransferase  44.74 
 
 
316 aa  291  1e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.180928  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4238  ornithine carbamoyltransferase  44.19 
 
 
316 aa  290  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0998  ornithine carbamoyltransferase  44.19 
 
 
316 aa  290  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  43.46 
 
 
304 aa  290  3e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  47.54 
 
 
314 aa  290  3e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4036  ornithine carbamoyltransferase  44.41 
 
 
316 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3883  ornithine carbamoyltransferase  43.55 
 
 
316 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4351  ornithine carbamoyltransferase  44.41 
 
 
316 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27136  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4199  ornithine carbamoyltransferase  43.75 
 
 
316 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4262  ornithine carbamoyltransferase  43.75 
 
 
316 aa  287  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  49.84 
 
 
313 aa  287  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  48.05 
 
 
303 aa  287  2e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  46.41 
 
 
311 aa  285  5e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  48.34 
 
 
306 aa  286  5e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  46.41 
 
 
311 aa  285  5e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
304 aa  285  8e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  48.56 
 
 
313 aa  284  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4152  ornithine carbamoyltransferase  43.75 
 
 
316 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  47.42 
 
 
312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  44.59 
 
 
301 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  46.73 
 
 
315 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  47.88 
 
 
303 aa  281  9e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  45.13 
 
 
303 aa  281  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  47.68 
 
 
309 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1113  ornithine carbamoyltransferase  48.37 
 
 
302 aa  281  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  48.68 
 
 
323 aa  280  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  47.68 
 
 
309 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  50.94 
 
 
309 aa  280  3e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3961  ornithine carbamoyltransferase  43.42 
 
 
316 aa  280  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000564713  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  46.56 
 
 
312 aa  279  4e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4159  ornithine carbamoyltransferase  45.7 
 
 
338 aa  277  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171177  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
312 aa  278  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  43.14 
 
 
302 aa  277  2e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2825  ornithine carbamoyltransferase  44.41 
 
 
316 aa  277  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  46.56 
 
 
313 aa  276  3e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  47.71 
 
 
300 aa  275  6e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  46.44 
 
 
309 aa  275  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  47.68 
 
 
298 aa  275  7e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16811  ornithine carbamoyltransferase  45.36 
 
 
318 aa  275  9e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1572  ornithine carbamoyltransferase  45.97 
 
 
304 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.951096 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  43.61 
 
 
307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  44.44 
 
 
307 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
323 aa  273  3e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  46.69 
 
 
306 aa  273  3e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0926  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
318 aa  273  4.0000000000000004e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.565714 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  45.13 
 
 
303 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  44.12 
 
 
309 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  43.79 
 
 
320 aa  272  6e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  44.16 
 
 
303 aa  272  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0340  ornithine carbamoyltransferase  45.3 
 
 
304 aa  271  1e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  42.86 
 
 
303 aa  270  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0395  ornithine carbamoyltransferase  46.75 
 
 
312 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5258  ornithine carbamoyltransferase  47.73 
 
 
309 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.802222  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  41.72 
 
 
307 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1054  ornithine carbamoyltransferase  45.3 
 
 
304 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  45.72 
 
 
313 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0514  ornithine carbamoyltransferase  46.08 
 
 
308 aa  268  7e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  49.19 
 
 
309 aa  268  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  43.32 
 
 
302 aa  268  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.661553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>