47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0274 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0274  membrane protein-like protein  100 
 
 		 399 aa  782    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.024335 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0317  membrane protein-like protein  88.16 
 
 		 425 aa  631  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0942874  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6914  hypothetical protein  41.16 
 
 		 359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8716  membrane protein-like protein  37.27 
 
 		 365 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5891  membrane protein-like protein  36.81 
 
 		 371 aa  196  7e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0515  hypothetical protein  36.39 
 
 		 388 aa  189  5.999999999999999e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4060  membrane protein-like protein  35.98 
 
 		 367 aa  177  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270426  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2373  membrane protein-like protein  38.04 
 
 		 378 aa  167  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4101  membrane protein-like protein  36.39 
 
 		 369 aa  162  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.453683 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3171  hypothetical protein  32.33 
 
 		 378 aa  159  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12810  predicted membrane protein  31.94 
 
 		 396 aa  154  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.157231  decreased coverage  0.00366432 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3085  membrane protein-like protein  34.29 
 
 		 373 aa  152  8e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157468 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0361  hypothetical protein  30.87 
 
 		 375 aa  129  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3414  hypothetical protein  34.19 
 
 		 379 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0201  hypothetical protein  32.22 
 
 		 375 aa  123  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0445  hypothetical protein  29.12 
 
 		 369 aa  117  5e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.379085 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0479  hypothetical protein  31.4 
 
 		 347 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3704  hypothetical protein  29.32 
 
 		 366 aa  106  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0978741  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2813  hypothetical protein  27.47 
 
 		 431 aa  106  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0370  hypothetical protein  30.04 
 
 		 347 aa  99.8  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.168954  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0385  hypothetical protein  30.04 
 
 		 347 aa  99.8  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12591  hypothetical protein  30.74 
 
 		 355 aa  94  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.168318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04990  predicted membrane protein  28.57 
 
 		 365 aa  90.1  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01600  hypothetical protein  26.92 
 
 		 389 aa  89.7  7e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25710  predicted membrane protein  27 
 
 		 443 aa  89.4  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3973  hypothetical protein  29.82 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215582  hitchhiker  0.00962889 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3027  membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2712  hypothetical protein  31.78 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.354831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2972  membrane protein-like protein  27.46 
 
 		 401 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211258  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2089  membrane protein  29.21 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1593  hypothetical protein  37.93 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419241  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2072  membrane protein-like protein  30.95 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000107578  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8385  protein of unknown function DUF939  27.01 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07150  predicted membrane protein  30.93 
 
 		 392 aa  52.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.269027 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  26.34 
 
 		 720 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2925  membrane protein-like protein  31.09 
 
 		 749 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119201  hitchhiker  0.0000166782 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05220  hypothetical protein  24.05 
 
 		 366 aa  46.6  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0817  membrane protein-like  30.37 
 
 		 384 aa  46.6  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2550  protein of unknown function DUF939  29.05 
 
 		 432 aa  46.2  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4561  membrane protein  24.91 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4954  integral membrane protein, YccS/YhfK family  25.74 
 
 		 727 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0511  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.25 
 
 		 727 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.917341 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5003  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.74 
 
 		 727 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4827  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.74 
 
 		 727 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1894  membrane protein-like protein  29.51 
 
 		 372 aa  43.9  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0482  protein of unknown function DUF939  22.09 
 
 		 353 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150379  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2001  YccS/YhfK family integral membrane protein  25.77 
 
 		 756 aa  43.5  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0304152  hitchhiker  0.00152336 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>