36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8716 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8716  membrane protein-like protein  100 
 
 		 365 aa  709    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6914  hypothetical protein  47.04 
 
 		 359 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0515  hypothetical protein  40 
 
 		 388 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4060  membrane protein-like protein  36.86 
 
 		 367 aa  187  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270426  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5891  membrane protein-like protein  38.07 
 
 		 371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0274  membrane protein-like protein  36.97 
 
 		 399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.024335 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0317  membrane protein-like protein  35.51 
 
 		 425 aa  178  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0942874  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0361  hypothetical protein  35.38 
 
 		 375 aa  173  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0201  hypothetical protein  35.96 
 
 		 375 aa  169  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3085  membrane protein-like protein  35.99 
 
 		 373 aa  169  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157468 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12810  predicted membrane protein  33.64 
 
 		 396 aa  168  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.157231  decreased coverage  0.00366432 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3171  hypothetical protein  34.69 
 
 		 378 aa  163  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4101  membrane protein-like protein  36 
 
 		 369 aa  160  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.453683 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3414  hypothetical protein  35.03 
 
 		 379 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01600  hypothetical protein  33.43 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2373  membrane protein-like protein  37.58 
 
 		 378 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3704  hypothetical protein  36.36 
 
 		 366 aa  144  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0978741  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0445  hypothetical protein  30.79 
 
 		 369 aa  137  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.379085 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25710  predicted membrane protein  30.75 
 
 		 443 aa  122  9e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3027  membrane protein-like protein  35.42 
 
 		 374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04990  predicted membrane protein  30.47 
 
 		 365 aa  119  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12591  hypothetical protein  27.24 
 
 		 355 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.168318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0479  hypothetical protein  29.66 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0385  hypothetical protein  26.2 
 
 		 347 aa  75.9  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0370  hypothetical protein  26.2 
 
 		 347 aa  75.9  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.168954  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3973  hypothetical protein  29.68 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215582  hitchhiker  0.00962889 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2813  hypothetical protein  30.23 
 
 		 431 aa  74.7  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2072  membrane protein-like protein  28.85 
 
 		 419 aa  72.8  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000107578  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2550  protein of unknown function DUF939  28.77 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07150  predicted membrane protein  27.06 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.269027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8385  protein of unknown function DUF939  30.06 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2712  hypothetical protein  27.04 
 
 		 395 aa  50.1  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.354831 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1593  hypothetical protein  36.28 
 
 		 176 aa  50.1  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419241  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2972  membrane protein-like protein  28.22 
 
 		 401 aa  47.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211258  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05220  hypothetical protein  22.03 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1894  membrane protein-like protein  25.83 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>