31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0445 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0445  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  719    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.379085 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04990  predicted membrane protein  48.15 
 
 		 365 aa  276  3e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3085  membrane protein-like protein  43.18 
 
 		 373 aa  251  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157468 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3414  hypothetical protein  40.57 
 
 		 379 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3027  membrane protein-like protein  41.64 
 
 		 374 aa  204  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0361  hypothetical protein  33.33 
 
 		 375 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4101  membrane protein-like protein  34.58 
 
 		 369 aa  168  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.453683 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0201  hypothetical protein  31.68 
 
 		 375 aa  164  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01600  hypothetical protein  33.15 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12810  predicted membrane protein  31.86 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.157231  decreased coverage  0.00366432 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0515  hypothetical protein  32.39 
 
 		 388 aa  142  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25710  predicted membrane protein  31.52 
 
 		 443 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4060  membrane protein-like protein  31.33 
 
 		 367 aa  135  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270426  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8716  membrane protein-like protein  30.79 
 
 		 365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6914  hypothetical protein  33.88 
 
 		 359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3171  hypothetical protein  29.63 
 
 		 378 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2373  membrane protein-like protein  32.09 
 
 		 378 aa  112  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5891  membrane protein-like protein  30.52 
 
 		 371 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3704  hypothetical protein  30.54 
 
 		 366 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0978741  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0317  membrane protein-like protein  28.95 
 
 		 425 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0942874  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0274  membrane protein-like protein  28.57 
 
 		 399 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.024335 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12591  hypothetical protein  29.45 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.168318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2813  hypothetical protein  26.53 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0479  hypothetical protein  26.2 
 
 		 347 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0385  hypothetical protein  25.51 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0370  hypothetical protein  25.51 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.168954  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2972  membrane protein-like protein  30.41 
 
 		 401 aa  49.7  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211258  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2089  membrane protein  25.76 
 
 		 409 aa  47  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1894  membrane protein-like protein  31.18 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3973  hypothetical protein  25.77 
 
 		 341 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215582  hitchhiker  0.00962889 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2712  hypothetical protein  28.11 
 
 		 395 aa  43.1  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.354831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>