43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0317 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0317  membrane protein-like protein  100 
 
 		 425 aa  834    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0942874  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0274  membrane protein-like protein  88.16 
 
 		 399 aa  630  1e-179  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.024335 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6914  hypothetical protein  41.26 
 
 		 359 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5891  membrane protein-like protein  36.81 
 
 		 371 aa  196  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8716  membrane protein-like protein  35.8 
 
 		 365 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0515  hypothetical protein  36.73 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4060  membrane protein-like protein  35.69 
 
 		 367 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270426  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2373  membrane protein-like protein  37.73 
 
 		 378 aa  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4101  membrane protein-like protein  35.82 
 
 		 369 aa  162  9e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.453683 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3171  hypothetical protein  32.05 
 
 		 378 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12810  predicted membrane protein  31.83 
 
 		 396 aa  153  5.9999999999999996e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.157231  decreased coverage  0.00366432 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3085  membrane protein-like protein  33.04 
 
 		 373 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157468 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0361  hypothetical protein  32.47 
 
 		 375 aa  126  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0201  hypothetical protein  31.94 
 
 		 375 aa  120  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0445  hypothetical protein  29.68 
 
 		 369 aa  120  6e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.379085 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3414  hypothetical protein  35.71 
 
 		 379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2813  hypothetical protein  28.93 
 
 		 431 aa  107  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3704  hypothetical protein  29.32 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0978741  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25710  predicted membrane protein  30.13 
 
 		 443 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0479  hypothetical protein  29.62 
 
 		 347 aa  99.8  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0370  hypothetical protein  27.93 
 
 		 347 aa  98.6  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.168954  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0385  hypothetical protein  27.93 
 
 		 347 aa  98.6  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12591  hypothetical protein  31.89 
 
 		 355 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.168318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04990  predicted membrane protein  29.54 
 
 		 365 aa  92  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3973  hypothetical protein  29.39 
 
 		 341 aa  87  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215582  hitchhiker  0.00962889 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01600  hypothetical protein  27.38 
 
 		 389 aa  86.7  8e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3027  membrane protein-like protein  32.35 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2712  hypothetical protein  28.97 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.354831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2972  membrane protein-like protein  29.29 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211258  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2089  membrane protein  29.55 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1593  hypothetical protein  37.24 
 
 		 176 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419241  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8385  protein of unknown function DUF939  26.8 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2072  membrane protein-like protein  30.05 
 
 		 419 aa  54.3  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000107578  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07150  predicted membrane protein  27.27 
 
 		 392 aa  50.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.269027 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2925  membrane protein-like protein  31.09 
 
 		 749 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00119201  hitchhiker  0.0000166782 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05220  hypothetical protein  24.2 
 
 		 366 aa  49.3  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4696  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  29.17 
 
 		 745 aa  46.6  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.427482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2550  protein of unknown function DUF939  26.09 
 
 		 432 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0482  protein of unknown function DUF939  22.14 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150379  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0817  membrane protein-like  30.66 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1894  membrane protein-like protein  30 
 
 		 372 aa  44.3  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4561  membrane protein  27.32 
 
 		 391 aa  43.9  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  28.41 
 
 		 720 aa  43.1  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>