25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2550 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2550  protein of unknown function DUF939  100 
 
 		 432 aa  838    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2072  membrane protein-like protein  38.27 
 
 		 419 aa  186  9e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000107578  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2756  membrane protein-like protein  38.75 
 
 		 427 aa  184  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4888  membrane protein-like protein  42.38 
 
 		 497 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8385  protein of unknown function DUF939  33.54 
 
 		 415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2972  membrane protein-like protein  28.91 
 
 		 401 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211258  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05220  hypothetical protein  28.02 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2089  membrane protein  29.63 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4561  membrane protein  28.44 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5223  membrane protein-like protein  26.67 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12591  hypothetical protein  28.1 
 
 		 355 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.168318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8716  membrane protein-like protein  28.77 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5891  membrane protein-like protein  34.1 
 
 		 371 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3085  membrane protein-like protein  26.5 
 
 		 373 aa  51.6  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157468 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0361  hypothetical protein  24.83 
 
 		 375 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2813  hypothetical protein  27.01 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25710  predicted membrane protein  25.3 
 
 		 443 aa  47.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2373  membrane protein-like protein  27.43 
 
 		 378 aa  46.6  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1355  protein of unknown function DUF939  23.53 
 
 		 359 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0303  protein of unknown function DUF939  24.6 
 
 		 324 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0015  hypothetical protein  27.92 
 
 		 380 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1427  hypothetical protein  26.49 
 
 		 328 aa  43.1  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0385  hypothetical protein  27.31 
 
 		 347 aa  43.1  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0201  hypothetical protein  23.68 
 
 		 375 aa  43.1  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0370  hypothetical protein  27.31 
 
 		 347 aa  43.1  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.168954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>