28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1593 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1593  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  340  5e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419241  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3973  hypothetical protein  44.83 
 
 		 341 aa  131  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215582  hitchhiker  0.00962889 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0479  hypothetical protein  41.13 
 
 		 347 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0370  hypothetical protein  40.41 
 
 		 347 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.168954  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0385  hypothetical protein  40.41 
 
 		 347 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5891  membrane protein-like protein  35.29 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12810  predicted membrane protein  33.82 
 
 		 396 aa  67.8  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.157231  decreased coverage  0.00366432 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3085  membrane protein-like protein  33.77 
 
 		 373 aa  67  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157468 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4060  membrane protein-like protein  37.96 
 
 		 367 aa  67  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270426  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8716  membrane protein-like protein  36.51 
 
 		 365 aa  65.1  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0515  hypothetical protein  36.31 
 
 		 388 aa  62.4  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01600  hypothetical protein  32.17 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25710  predicted membrane protein  30.64 
 
 		 443 aa  59.7  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3171  hypothetical protein  34.33 
 
 		 378 aa  58.2  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0274  membrane protein-like protein  38.76 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.024335 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0201  hypothetical protein  34.45 
 
 		 375 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0317  membrane protein-like protein  36.43 
 
 		 425 aa  55.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0942874  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3414  hypothetical protein  33.11 
 
 		 379 aa  55.5  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0361  hypothetical protein  27.52 
 
 		 375 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2813  hypothetical protein  33.58 
 
 		 431 aa  52  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12591  hypothetical protein  27.44 
 
 		 355 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.168318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3027  membrane protein-like protein  34.07 
 
 		 374 aa  49.7  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0445  hypothetical protein  26.54 
 
 		 369 aa  47.8  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.379085 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2373  membrane protein-like protein  33.06 
 
 		 378 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04990  predicted membrane protein  40 
 
 		 365 aa  45.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8385  protein of unknown function DUF939  29.86 
 
 		 415 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6914  hypothetical protein  33.33 
 
 		 359 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2712  hypothetical protein  31.67 
 
 		 395 aa  40.8  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.354831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>