29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0201 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0201  hypothetical protein  100 
 
 
375 aa  738    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0361  hypothetical protein  87.47 
 
 
375 aa  652    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01600  hypothetical protein  47.66 
 
 
389 aa  302  5.000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3085  membrane protein-like protein  42.78 
 
 
373 aa  261  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157468 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3414  hypothetical protein  34.89 
 
 
379 aa  186  7e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4101  membrane protein-like protein  33.78 
 
 
369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.453683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8716  membrane protein-like protein  35.38 
 
 
365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0445  hypothetical protein  31.68 
 
 
369 aa  164  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.379085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6914  hypothetical protein  34.73 
 
 
359 aa  156  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25710  predicted membrane protein  32.38 
 
 
443 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04990  predicted membrane protein  34.15 
 
 
365 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5891  membrane protein-like protein  36.61 
 
 
371 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12810  predicted membrane protein  28.41 
 
 
396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.157231  decreased coverage  0.00366432 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4060  membrane protein-like protein  32.1 
 
 
367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270426  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3027  membrane protein-like protein  34.44 
 
 
374 aa  138  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0515  hypothetical protein  34.88 
 
 
388 aa  133  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3704  hypothetical protein  28.48 
 
 
366 aa  122  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0978741  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3171  hypothetical protein  30.17 
 
 
378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2373  membrane protein-like protein  30.35 
 
 
378 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0274  membrane protein-like protein  30.75 
 
 
399 aa  90.9  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.024335 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0317  membrane protein-like protein  30.83 
 
 
425 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0942874  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3973  hypothetical protein  30.53 
 
 
341 aa  64.7  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215582  hitchhiker  0.00962889 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12591  hypothetical protein  28.57 
 
 
355 aa  57  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.168318  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0479  hypothetical protein  29.82 
 
 
347 aa  53.5  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2813  hypothetical protein  25.4 
 
 
431 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0385  hypothetical protein  28.25 
 
 
347 aa  52  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0370  hypothetical protein  28.25 
 
 
347 aa  52  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.168954  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2550  protein of unknown function DUF939  25 
 
 
432 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1593  hypothetical protein  36.52 
 
 
176 aa  42.7  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>