29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12810 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_12810  predicted membrane protein  100 
 
 		 396 aa  784    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.157231  decreased coverage  0.00366432 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3085  membrane protein-like protein  36.39 
 
 		 373 aa  188  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157468 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3704  hypothetical protein  38.87 
 
 		 366 aa  176  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0978741  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0515  hypothetical protein  34.2 
 
 		 388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6914  hypothetical protein  34.75 
 
 		 359 aa  172  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8716  membrane protein-like protein  33.05 
 
 		 365 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3414  hypothetical protein  35.07 
 
 		 379 aa  164  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0361  hypothetical protein  29.06 
 
 		 375 aa  156  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4060  membrane protein-like protein  32.39 
 
 		 367 aa  155  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270426  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5891  membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 371 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0445  hypothetical protein  31.87 
 
 		 369 aa  151  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.379085 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4101  membrane protein-like protein  33.51 
 
 		 369 aa  144  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.453683 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0201  hypothetical protein  28.29 
 
 		 375 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0274  membrane protein-like protein  30.62 
 
 		 399 aa  133  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.024335 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0317  membrane protein-like protein  31.55 
 
 		 425 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0942874  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3171  hypothetical protein  31.67 
 
 		 378 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04990  predicted membrane protein  31.73 
 
 		 365 aa  123  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3027  membrane protein-like protein  32.05 
 
 		 374 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2373  membrane protein-like protein  34.23 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01600  hypothetical protein  24.94 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25710  predicted membrane protein  27.71 
 
 		 443 aa  99  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2813  hypothetical protein  33.33 
 
 		 431 aa  92  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0370  hypothetical protein  33.14 
 
 		 347 aa  87.8  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.168954  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0385  hypothetical protein  33.14 
 
 		 347 aa  87.8  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0479  hypothetical protein  29.81 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12591  hypothetical protein  27.02 
 
 		 355 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.168318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3973  hypothetical protein  28.27 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215582  hitchhiker  0.00962889 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1593  hypothetical protein  33.59 
 
 		 176 aa  50.4  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419241  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2712  hypothetical protein  27.94 
 
 		 395 aa  50.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.354831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>