20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_07150 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_07150  predicted membrane protein  100 
 
 		 392 aa  758    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.269027 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0817  membrane protein-like  38.4 
 
 		 384 aa  181  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1894  membrane protein-like protein  30.77 
 
 		 372 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3804  hypothetical protein  36.31 
 
 		 365 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2147  membrane protein-like protein  33.8 
 
 		 373 aa  103  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0231192  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2089  membrane protein  27.91 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5223  membrane protein-like protein  29.38 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05220  hypothetical protein  25.48 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4561  membrane protein  27.65 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8716  membrane protein-like protein  27.06 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5891  membrane protein-like protein  29.82 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12591  hypothetical protein  27.07 
 
 		 355 aa  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.168318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2972  membrane protein-like protein  27.97 
 
 		 401 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211258  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8385  protein of unknown function DUF939  28.4 
 
 		 415 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3085  membrane protein-like protein  28.25 
 
 		 373 aa  47  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2072  membrane protein-like protein  23.13 
 
 		 419 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000107578  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0479  hypothetical protein  27.96 
 
 		 347 aa  43.9  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4060  membrane protein-like protein  22.89 
 
 		 367 aa  43.5  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270426  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2373  membrane protein-like protein  29.41 
 
 		 378 aa  43.1  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2756  membrane protein-like protein  29.44 
 
 		 427 aa  42.7  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>