23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2147 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2147  membrane protein-like protein  100 
 
 
373 aa  739    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0231192  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1894  membrane protein-like protein  62.5 
 
 
372 aa  424  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0817  membrane protein-like  33.57 
 
 
384 aa  118  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07150  predicted membrane protein  32.87 
 
 
392 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.269027 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2089  membrane protein  26.76 
 
 
409 aa  93.2  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3804  hypothetical protein  27.47 
 
 
365 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05220  hypothetical protein  26.73 
 
 
366 aa  77.8  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5223  membrane protein-like protein  29.41 
 
 
348 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2756  membrane protein-like protein  27.09 
 
 
427 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8385  protein of unknown function DUF939  24.62 
 
 
415 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2972  membrane protein-like protein  24.39 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211258  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2072  membrane protein-like protein  25.19 
 
 
419 aa  53.9  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000107578  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  29.05 
 
 
338 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4888  membrane protein-like protein  26.05 
 
 
497 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3675  protein of unknown function DUF939  27.27 
 
 
708 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2550  protein of unknown function DUF939  26.03 
 
 
432 aa  49.7  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5891  membrane protein-like protein  28 
 
 
371 aa  47  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  24.71 
 
 
359 aa  46.6  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1943  membrane protein-like protein  22.26 
 
 
328 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1977  hypothetical protein  22.26 
 
 
328 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8716  membrane protein-like protein  25.75 
 
 
365 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1378  protein of unknown function DUF939  24.85 
 
 
369 aa  44.3  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000180772  normal  0.221416 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2813  hypothetical protein  26.29 
 
 
431 aa  43.9  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>