19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5223 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5223  membrane protein-like protein  100 
 
 
348 aa  698    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2072  membrane protein-like protein  30.62 
 
 
419 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000107578  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05220  hypothetical protein  29.27 
 
 
366 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8385  protein of unknown function DUF939  28.28 
 
 
415 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2089  membrane protein  27.83 
 
 
409 aa  89.7  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2756  membrane protein-like protein  31.25 
 
 
427 aa  88.6  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4561  membrane protein  26.91 
 
 
391 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2550  protein of unknown function DUF939  27.27 
 
 
432 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07150  predicted membrane protein  29.67 
 
 
392 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.269027 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2147  membrane protein-like protein  29.41 
 
 
373 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0231192  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1894  membrane protein-like protein  29.95 
 
 
372 aa  72.8  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2972  membrane protein-like protein  25.7 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211258  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4888  membrane protein-like protein  33.62 
 
 
497 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  30.67 
 
 
361 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12591  hypothetical protein  29.12 
 
 
355 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.168318  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  28.49 
 
 
363 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1355  protein of unknown function DUF939  23 
 
 
359 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0817  membrane protein-like  28.04 
 
 
384 aa  43.5  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  22.6 
 
 
360 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>