30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0062 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0062  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  781    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.199753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1926  bifunctional DNA primase/polymerase  57.14 
 
 		 377 aa  382  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.394144  hitchhiker  0.00427695 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3733  Bifunctional DNA primase/polymerase  40.91 
 
 		 271 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  31.25 
 
 		 955 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  31.25 
 
 		 749 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.83 
 
 		 970 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3896  hypothetical protein  34.2 
 
 		 692 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.425308  normal  0.91209 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.94 
 
 		 970 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  31.84 
 
 		 746 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  31.84 
 
 		 746 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1167  bifunctional DNA primase/polymerase  32.87 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1201  hypothetical protein  32.01 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000142595  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5166  bifunctional DNA primase/polymerase  35.22 
 
 		 289 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1213  bifunctional DNA primase/polymerase  31.11 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0963471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0745  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.24 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127407  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1451  bifunctional DNA primase/polymerase  25.75 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0151027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  30.42 
 
 		 717 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4212  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.29 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567212  normal  0.394336 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2001  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.16 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.185171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1177  Bifunctional DNA primase/polymerase  31.56 
 
 		 283 aa  57  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0603476  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  29.58 
 
 		 717 aa  56.6  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1980  hypothetical protein  29.18 
 
 		 266 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1983  Bifunctional DNA primase/polymerase  33.33 
 
 		 201 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2824  hypothetical protein  27.57 
 
 		 263 aa  53.5  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000228641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6679  Bifunctional DNA primase/polymerase  32.79 
 
 		 201 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2020  hypothetical protein  28.31 
 
 		 263 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2853  prophage Lp4 protein 7, DNA replication  28.28 
 
 		 266 aa  50.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000416381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  30.08 
 
 		 717 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  25 
 
 		 746 aa  47.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1224  ATPase-like protein  37.08 
 
 		 719 aa  43.9  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>