35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0021 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0021  Fe-S metabolism associated SufE  100 
 
 		 142 aa  279  7.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0025  Fe-S metabolism associated SufE  82.73 
 
 		 139 aa  234  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2300  Fe-S metabolism associated SufE  46.76 
 
 		 146 aa  123  8.000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1339  Fe-S metabolism associated SufE  46.48 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.195194 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10710  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  47.95 
 
 		 152 aa  118  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00761563  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3080  Fe-S metabolism associated SufE  48.23 
 
 		 153 aa  116  7.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0512259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4781  Fe-S metabolism associated SufE  47.76 
 
 		 136 aa  115  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2207  Fe-S metabolism associated SufE  42.03 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1668  Fe-S metabolism associated SufE  46.81 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13313  hypothetical protein  47.06 
 
 		 143 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1665  Fe-S metabolism associated SufE  45.71 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.336696  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1658  Fe-S metabolism associated SufE  43.84 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000451516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1290  Fe-S metabolism associated SufE  47.06 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1307  Fe-S metabolism associated SufE  47.06 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200805  normal  0.160903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1326  Fe-S metabolism associated SufE  47.06 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1033  Fe-S metabolism associated SufE  46.62 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1834  Fe-S metabolism associated SufE  46.04 
 
 		 149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.715701  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0313  Fe-S metabolism associated SufE  48.87 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0231969 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0718  Fe-S metabolism associated SufE  45.11 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0436027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16610  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  41.43 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0911  Fe-S metabolism associated SufE  45.65 
 
 		 148 aa  94  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.539194  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03580  SufE protein probably involved in Fe-S center assembly  39.16 
 
 		 150 aa  93.6  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2651  Fe-S metabolism associated SufE  42.14 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2220  Fe-S metabolism associated SufE  45.86 
 
 		 146 aa  90.5  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00317725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0984  Fe-S metabolism associated SufE  38.69 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.976198  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1978  Fe-S metabolism associated SufE  31.11 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118072 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1334  Fe-S metabolism associated SufE  26.13 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1471  hypothetical protein  25.17 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3157  Fe-S metabolism associated SufE  27.78 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1526  sufE protein  26.36 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1885  Fe-S metabolism associated SufE  27.56 
 
 		 136 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0116695  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0997  hypothetical protein  22.9 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0249  Fe-S metabolism associated SufE  28.12 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04475  hypothetical protein  21.98 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16920  hypothetical protein  24.44 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.106423  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>