More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2653 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2653  ribosomal protein L21  100 
 
 		 102 aa  201  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000599107  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0497  ribosomal protein L21  66 
 
 		 98 aa  126  9.000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  54.9 
 
 		 104 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  59.41 
 
 		 103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  59.41 
 
 		 103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 103 aa  107  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  58.42 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  50 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  52.48 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  57.84 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  50.49 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  49.02 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  49.51 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 131 aa  98.6  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 102 aa  97.8  4e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  97.4  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 104 aa  97.4  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  96.7  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  96.7  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  95.9  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  96.7  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2695  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 102 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  94.7  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  94.7  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  94.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3652  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3219  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000619372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  93.6  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  44.12 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2576  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2704  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  91.7  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  90.9  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  90.9  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  90.9  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2001  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 120 aa  90.9  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536247  normal  0.99837 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  48.08 
 
 		 115 aa  90.5  7e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  90.5  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3033  ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 104 aa  90.1  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  90.1  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 102 aa  90.1  9e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>