More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4495 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
340 aa  679  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  56.33 
 
 
346 aa  332  4e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  53.37 
 
 
331 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  51.57 
 
 
348 aa  301  1e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  52.13 
 
 
334 aa  298  8e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  50.16 
 
 
342 aa  293  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  50.16 
 
 
326 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  48.48 
 
 
350 aa  291  8e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3344  transcriptional regulator, AraC family  51.13 
 
 
306 aa  291  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107128  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  50.96 
 
 
350 aa  289  5e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  52.73 
 
 
333 aa  288  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  48.47 
 
 
329 aa  288  9e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  48.73 
 
 
322 aa  286  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3284  transcriptional activator FtrA  49.2 
 
 
333 aa  285  6e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.059892 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3031  transcriptional activator FtrA  48.2 
 
 
333 aa  284  2e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00937108  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  46.42 
 
 
321 aa  283  3e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0514  transcriptional regulator, AraC family  50.48 
 
 
334 aa  283  4e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  47.99 
 
 
327 aa  282  5e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  51.61 
 
 
362 aa  282  5e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  48.4 
 
 
320 aa  282  5e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  51.43 
 
 
333 aa  282  6e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  51.92 
 
 
313 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  46.15 
 
 
335 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  52.04 
 
 
338 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  46.15 
 
 
335 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  46.15 
 
 
335 aa  279  5e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  45.48 
 
 
329 aa  278  9e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  50.64 
 
 
330 aa  278  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  1.6632e-11 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3780  transcriptional regulator, AraC family  45.83 
 
 
335 aa  275  6e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  50.62 
 
 
342 aa  275  7e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  50.17 
 
 
324 aa  275  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  47.37 
 
 
331 aa  274  1e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  47.27 
 
 
328 aa  275  1e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  47.09 
 
 
326 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  51.43 
 
 
341 aa  273  4e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  51.43 
 
 
341 aa  273  4e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  45.62 
 
 
347 aa  272  6e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  51.75 
 
 
338 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  48.73 
 
 
323 aa  271  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  44.83 
 
 
325 aa  270  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  45.51 
 
 
322 aa  269  4e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.89765e-07 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  49.36 
 
 
313 aa  269  6e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  43.23 
 
 
317 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  44.34 
 
 
326 aa  268  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  49.38 
 
 
356 aa  268  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  51.13 
 
 
330 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  45.48 
 
 
333 aa  267  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2150  transcriptional activator FtrA  43.21 
 
 
330 aa  267  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.077741  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  47.62 
 
 
316 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2051  transcriptional regulator, AraC family  49.19 
 
 
344 aa  267  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  46.05 
 
 
318 aa  266  3e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  46.05 
 
 
318 aa  266  3e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  46.05 
 
 
318 aa  266  3e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  47.68 
 
 
324 aa  266  3e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  46.05 
 
 
318 aa  266  3e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  46.05 
 
 
318 aa  266  3e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  46.05 
 
 
318 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4599  transcriptional regulator, AraC family  50.32 
 
 
332 aa  266  5e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  46.98 
 
 
317 aa  265  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  45.17 
 
 
327 aa  265  7e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  47.04 
 
 
324 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  42.58 
 
 
317 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  47.02 
 
 
324 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  5.80095e-05 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  52.06 
 
 
333 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  46.67 
 
 
317 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  2.98096e-05 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  47.02 
 
 
324 aa  262  5e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  43.93 
 
 
326 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  43.93 
 
 
326 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  44.84 
 
 
321 aa  262  7e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  46.84 
 
 
331 aa  261  9e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  46.84 
 
 
331 aa  261  9e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2133  transcriptional regulator, AraC family  49.05 
 
 
321 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  46.69 
 
 
320 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  46.05 
 
 
321 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  46.69 
 
 
320 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  43.93 
 
 
326 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  48.28 
 
 
319 aa  260  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1760  transcriptional activator FtrA  45.16 
 
 
318 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3445  transcriptional regulator  47.78 
 
 
320 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3394  transcriptional regulator  47.78 
 
 
320 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482598  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3383  transcriptional regulator  47.78 
 
 
320 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  47.94 
 
 
333 aa  258  9e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  46.01 
 
 
321 aa  258  9e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4142  transcriptional regulator, AraC family  47.15 
 
 
318 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00637596  normal  0.887483 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  43.59 
 
 
318 aa  258  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  47.42 
 
 
320 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  46.03 
 
 
320 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  47.94 
 
 
332 aa  256  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5233  AraC family transcriptional regulator  45.86 
 
 
349 aa  255  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3331  transcriptional regulator, AraC family  50.49 
 
 
348 aa  255  1e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  44.05 
 
 
333 aa  253  2e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  49.16 
 
 
314 aa  254  2e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  50.16 
 
 
325 aa  254  2e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  47.78 
 
 
320 aa  253  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0705  AraC family transcriptional regulator  51.92 
 
 
331 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3112  ThiJ/PfpI domain protein  44.55 
 
 
321 aa  250  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  44.55 
 
 
332 aa  249  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5179  transcriptional regulator, AraC family  46.71 
 
 
352 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5972  transcriptional regulator, AraC family  44.17 
 
 
343 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.95 
 
 
330 aa  248  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276432  normal  0.168058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>