More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2436 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3291  glycerol kinase  62.97 
 
 		 505 aa  637    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503481  hitchhiker  0.00561872 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0558  glycerol kinase  64.41 
 
 		 506 aa  638    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000280451 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0072  glycerol kinase  66 
 
 		 498 aa  644    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.811469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6409  glycerol kinase  65.08 
 
 		 504 aa  638    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5241  glycerol kinase  79.41 
 
 		 510 aa  848    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2094  glycerol kinase  60.59 
 
 		 505 aa  635    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.141027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4610  glycerol kinase  80.79 
 
 		 505 aa  829    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53561  normal  0.440109 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1008  glycerol kinase  79.88 
 
 		 510 aa  815    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822011  hitchhiker  0.00553696 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0389  glycerol kinase  63.17 
 
 		 504 aa  640    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.171673  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4873  glycerol kinase  79.21 
 
 		 510 aa  848    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2436  glycerol kinase  100 
 
 		 505 aa  1032    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0494  glycerol kinase  80.99 
 
 		 505 aa  831    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2463  glycerol kinase  80.59 
 
 		 505 aa  828    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5124  glycerol kinase  81.78 
 
 		 506 aa  813    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7482  glycerol kinase  94.05 
 
 		 505 aa  948    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0380  glycerol kinase  63.49 
 
 		 507 aa  659    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1327  glycerol kinase  79.8 
 
 		 505 aa  824    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4962  glycerol kinase  79.21 
 
 		 510 aa  848    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5467  glycerol kinase  79.21 
 
 		 505 aa  820    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13727  glycerol kinase  78.33 
 
 		 517 aa  819    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.45379 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1214  glycerol kinase  85.91 
 
 		 505 aa  887    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133929  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1985  glycerol kinase  63.17 
 
 		 504 aa  634  1e-180  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119795 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0485  glycerol kinase  61.55 
 
 		 505 aa  629  1e-179  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.361575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2248  glycerol kinase  63.37 
 
 		 504 aa  629  1e-179  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0805048  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05770  glycerol kinase  64.21 
 
 		 504 aa  625  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29920  glycerol kinase  59.41 
 
 		 514 aa  622  1e-177  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06800  glycerol kinase  61.35 
 
 		 505 aa  622  1e-177  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5042  glycerol kinase  63.04 
 
 		 505 aa  615  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1434  glycerol kinase  58.85 
 
 		 503 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12289  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5299  glycerol kinase  63.82 
 
 		 503 aa  611  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23050  glycerol kinase  62.15 
 
 		 510 aa  603  1.0000000000000001e-171  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0798  glycerol kinase  64.06 
 
 		 496 aa  598  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.421282  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1768  glycerol kinase  60.83 
 
 		 498 aa  600  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2384  glycerol kinase  60.24 
 
 		 499 aa  595  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3917  glycerol kinase  59.96 
 
 		 499 aa  589  1e-167  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3902  glycerol kinase  60.28 
 
 		 499 aa  589  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1086  glycerol kinase  59.64 
 
 		 499 aa  588  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0915009  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4220  glycerol kinase  61.43 
 
 		 509 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.517314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1798  glycerol kinase  60.97 
 
 		 502 aa  577  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.603788  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1553  glycerol kinase  57.48 
 
 		 509 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5935  glycerol kinase  58.96 
 
 		 500 aa  572  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4547  glycerol kinase  60.04 
 
 		 501 aa  568  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4433  glycerol kinase  60.44 
 
 		 501 aa  570  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4066  glycerol kinase  60.04 
 
 		 501 aa  567  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.737182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2178  glycerol kinase  57.68 
 
 		 501 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.976336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1919  glycerol kinase  58.17 
 
 		 497 aa  561  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1000  glycerol kinase  55.86 
 
 		 504 aa  561  1.0000000000000001e-159  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2331  glycerol kinase  58.85 
 
 		 499 aa  563  1.0000000000000001e-159  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1395  glycerol kinase  57.03 
 
 		 505 aa  561  1e-158  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000530901  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15590  glycerol kinase  60.2 
 
 		 514 aa  558  1e-158  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.208439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  54.82 
 
 		 496 aa  553  1e-156  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  54.67 
 
 		 498 aa  549  1e-155  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  54.42 
 
 		 496 aa  549  1e-155  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  53.97 
 
 		 497 aa  547  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4607  glycerol kinase  56.51 
 
 		 507 aa  545  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0538756  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7485  glycerol kinase  55.91 
 
 		 505 aa  544  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5127  glycerol kinase  55.98 
 
 		 507 aa  544  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0497  glycerol kinase  55.91 
 
 		 507 aa  537  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.493772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2514  glycerol kinase  52.36 
 
 		 510 aa  538  1e-151  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.29996 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1021  glycerol kinase  55.58 
 
 		 522 aa  537  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0896749  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1122  glycerol kinase  52.33 
 
 		 513 aa  533  1e-150  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3649  glycerol kinase  55.6 
 
 		 499 aa  531  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2963  glycerol kinase  50.79 
 
 		 513 aa  533  1e-150  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  57.2 
 
 		 500 aa  527  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0934  glycerol kinase  50.59 
 
 		 527 aa  523  1e-147  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  51.3 
 
 		 498 aa  524  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  52.96 
 
 		 520 aa  523  1e-147  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  53.94 
 
 		 498 aa  525  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  51.3 
 
 		 498 aa  524  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  52.79 
 
 		 499 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3822  glycerol kinase  52.62 
 
 		 493 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  50.9 
 
 		 496 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  52.3 
 
 		 502 aa  515  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  51.8 
 
 		 505 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  52.79 
 
 		 499 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1128  glycerol kinase  52.32 
 
 		 523 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  52.4 
 
 		 499 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.24675 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  52.09 
 
 		 502 aa  514  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  51.6 
 
 		 499 aa  512  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  51.69 
 
 		 502 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  52 
 
 		 518 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  52.09 
 
 		 502 aa  514  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  52.09 
 
 		 502 aa  514  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  52 
 
 		 503 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  50.7 
 
 		 496 aa  513  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  52.09 
 
 		 502 aa  512  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  50 
 
 		 496 aa  511  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  51.88 
 
 		 499 aa  514  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  52.09 
 
 		 502 aa  514  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_50770  predicted protein  51.71 
 
 		 549 aa  511  1e-144  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  51.69 
 
 		 502 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  51.69 
 
 		 502 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  51.89 
 
 		 502 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  52.5 
 
 		 499 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  52 
 
 		 518 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  50.5 
 
 		 496 aa  511  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  52.09 
 
 		 502 aa  514  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  52 
 
 		 518 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  52 
 
 		 518 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  52 
 
 		 518 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>