61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0380 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0380  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3383  protein of unknown function DUF820  68.45 
 
 
187 aa  244  6.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0149444  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2097  protein of unknown function DUF820  64.02 
 
 
191 aa  236  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2991  protein of unknown function DUF820  55.43 
 
 
188 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0645262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2118  protein of unknown function DUF820  56.67 
 
 
201 aa  181  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0557  hypothetical protein  52.38 
 
 
201 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140412  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1153  hypothetical protein  52.11 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5162  protein of unknown function DUF820  52.88 
 
 
197 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.688215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8443  protein of unknown function DUF820  47.86 
 
 
142 aa  121  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0498606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  39.33 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2128  hypothetical protein  34.25 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578066  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6498  hypothetical protein  31.25 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.188707  normal  0.480601 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2159  protein of unknown function DUF820  35.71 
 
 
189 aa  59.3  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2157  protein of unknown function DUF820  34.13 
 
 
185 aa  58.5  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2158  protein of unknown function DUF820  34.71 
 
 
186 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  30.95 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4310  hypothetical protein  34.38 
 
 
197 aa  56.2  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  33.99 
 
 
186 aa  55.5  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3045  hypothetical protein  31.85 
 
 
198 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3083  hypothetical protein  26.8 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.439197  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2224  hypothetical protein  36.23 
 
 
219 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108334  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4570  protein of unknown function DUF820  30.82 
 
 
198 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.432927  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7645  protein of unknown function DUF820  32.34 
 
 
198 aa  52  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0392  protein of unknown function DUF820  31.65 
 
 
200 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0401  protein of unknown function DUF820  31.65 
 
 
200 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.387775  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2309  hypothetical protein  31.21 
 
 
191 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3790  protein of unknown function DUF820  27.97 
 
 
190 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3415  protein of unknown function DUF820  29.75 
 
 
186 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0193  protein of unknown function DUF820  28.48 
 
 
186 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2740  hypothetical protein  34.17 
 
 
204 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  30.68 
 
 
191 aa  48.5  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1720  protein of unknown function DUF820  29.46 
 
 
210 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00000927877  decreased coverage  0.000371214 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  25.99 
 
 
193 aa  47.8  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  29.63 
 
 
257 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3352  hypothetical protein  30.13 
 
 
210 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0400145  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8829  protein of unknown function DUF820  29.21 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  28.02 
 
 
204 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5079  protein of unknown function DUF820  32.82 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.581399 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0217  hypothetical protein  28.89 
 
 
186 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3548  hypothetical protein  31.58 
 
 
188 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3408  protein of unknown function DUF820  26.55 
 
 
181 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.393779  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4762  protein of unknown function DUF820  27.94 
 
 
202 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2695  protein of unknown function DUF820  26.55 
 
 
181 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  27.22 
 
 
190 aa  45.4  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3738  protein of unknown function DUF820  29.01 
 
 
190 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1502  hypothetical protein  25.87 
 
 
194 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155275  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4750  protein of unknown function DUF820  30 
 
 
187 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  hitchhiker  0.000000893331 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  24.35 
 
 
180 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0075  protein of unknown function DUF820  27.07 
 
 
184 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.928941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1522  hypothetical protein  28.4 
 
 
209 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.793245  hitchhiker  0.00163452 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3149  hypothetical protein  27.16 
 
 
185 aa  43.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00139677  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2404  hypothetical protein  33.09 
 
 
205 aa  42.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586663  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3939  protein of unknown function DUF820  28.41 
 
 
202 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.117459  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  24.49 
 
 
183 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0762  hypothetical protein  29.41 
 
 
187 aa  42.7  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000676574  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4246  protein of unknown function DUF820  26.67 
 
 
194 aa  42.4  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  31.34 
 
 
197 aa  42.4  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3996  hypothetical protein  29.79 
 
 
186 aa  42  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0685  hypothetical protein  36.76 
 
 
205 aa  42  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142193  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1881  protein of unknown function DUF820  30.09 
 
 
182 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.749707  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1855  protein of unknown function DUF820  30.09 
 
 
182 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>