More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0050 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0050  pirin domain-containing protein  100 
 
 		 307 aa  634    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0017274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0058  pirin domain-containing protein  87.95 
 
 		 307 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000580792 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0057  Pirin domain protein  87.95 
 
 		 307 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4301  pirin domain-containing protein  87.62 
 
 		 307 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.411445  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0053  pirin domain-containing protein  87.3 
 
 		 307 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0055  pirin domain-containing protein  83.71 
 
 		 307 aa  547  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0053  pirin domain-containing protein  84.04 
 
 		 307 aa  549  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0061  pirin domain-containing protein  82.57 
 
 		 308 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000222873 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3541  pirin-like protein  63.89 
 
 		 297 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1778  Pirin-like protein  59.93 
 
 		 313 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0050  Pirin-like protein  57.63 
 
 		 301 aa  345  6e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4173  hypothetical protein  52.43 
 
 		 332 aa  332  6e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48730  hypothetical protein  52.75 
 
 		 315 aa  331  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159869 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2835  pirin domain-containing protein  51.29 
 
 		 313 aa  329  3e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3147  Pirin domain protein  53.33 
 
 		 301 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0919  pirin domain-containing protein  47.4 
 
 		 338 aa  258  6e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2304  pirin domain-containing protein  39.74 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000453876  normal  0.0236921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0490  Pirin domain protein  43.17 
 
 		 322 aa  226  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0687764  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1645  Pirin domain protein  41.37 
 
 		 324 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2016  Pirin domain protein  36.33 
 
 		 343 aa  205  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.656131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5681  pirin domain-containing protein  39.39 
 
 		 317 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5391  pirin domain-containing protein  39.39 
 
 		 317 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5302  Pirin-like protein  39.39 
 
 		 317 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.178895  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0788  pirin domain-containing protein  36.54 
 
 		 321 aa  202  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0062  pirin domain-containing protein  38.85 
 
 		 321 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2558  Pirin domain protein  37.29 
 
 		 336 aa  200  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000413123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2245  hypothetical protein  39.41 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169099  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2745  Pirin domain-containing protein  36.54 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.211686  normal  0.964257 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3190  Pirin domain protein  37.22 
 
 		 351 aa  196  5.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0508  Pirin domain protein  36.19 
 
 		 329 aa  196  6e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3726  Pirin domain protein  36.3 
 
 		 336 aa  195  7e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4144  Pirin domain protein  37.59 
 
 		 329 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.173069  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0663  pirin domain-containing protein  39.6 
 
 		 351 aa  192  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35540  Pirin-related protein  32.74 
 
 		 381 aa  189  5.999999999999999e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2844  pirin domain-containing protein  34.94 
 
 		 363 aa  189  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.923717  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3633  Pirin domain protein  35.5 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3476  Pirin domain protein  39.1 
 
 		 319 aa  187  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.944311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3781  Pirin-like  40.14 
 
 		 294 aa  186  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.871122 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0566  Pirin domain protein  39.79 
 
 		 307 aa  185  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.660641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0100  Pirin domain protein  36.21 
 
 		 335 aa  185  9e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0493  pirin domain-containing protein  38.46 
 
 		 307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0608  Pirin domain protein  38.75 
 
 		 307 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.228088 
 
 
-
 
NC_004310  BR0435  pirin-related protein  38.63 
 
 		 290 aa  177  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3573  Pirin domain protein  37.45 
 
 		 307 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1805  Pirin domain protein  37.06 
 
 		 296 aa  177  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1596  Pirin domain protein  38.97 
 
 		 301 aa  176  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3489  Pirin-like  37.82 
 
 		 307 aa  175  9e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3641  Pirin domain protein  36.73 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0286  pirin-related protein  38.81 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1666  pirin-related protein  34.97 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0486523  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2278  pirin domain-containing protein  37.24 
 
 		 301 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263885  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1965  pirin domain-containing protein  36.46 
 
 		 309 aa  172  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0444426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2089  Pirin domain protein  37.5 
 
 		 304 aa  172  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2913  Pirin-like  36.24 
 
 		 296 aa  172  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0546  pirin domain-containing protein  36.96 
 
 		 306 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266378  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0326  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  38.24 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0273  Pirin-like protein  36.88 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.355193 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2897  Pirin-like  39.31 
 
 		 294 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4923  Pirin domain protein  34.89 
 
 		 310 aa  170  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.695284  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0734  Pirin-like  37.76 
 
 		 306 aa  169  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0517  pirin domain-containing protein  40.53 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.858026 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04763  pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  37.79 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0588  putative pirin-like protein  40.14 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.927348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0019  putative Pirin family protein  36.27 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0744  hypothetical protein  39.69 
 
 		 291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.738482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3696  Pirin domain protein  34.04 
 
 		 300 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.01108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0346  Pirin-like  37.91 
 
 		 305 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3490  pirin domain-containing protein  33.33 
 
 		 293 aa  165  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.970505  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3218  Pirin domain protein  39.08 
 
 		 291 aa  165  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0561  Pirin domain protein  37.5 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2372  pirin domain-containing protein  33.83 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178763  normal  0.995053 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0640  pirin-related protein  37.92 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.524638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1889  Pirin-like  34.14 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2484  pirin domain-containing protein  38.7 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0887266 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0149  Pirin-like  37.28 
 
 		 305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0009  Pirin-like  36.68 
 
 		 306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00543202  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3120  Pirin domain protein  37.17 
 
 		 307 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0703  Pirin-like protein  37.41 
 
 		 305 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0818  pirin domain-containing protein  37.31 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0128  Pirin domain protein  34.49 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.266704 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0185  pirin domain-containing protein  34.49 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2983  Pirin domain protein  36.43 
 
 		 287 aa  159  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.373808  normal  0.0595027 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3027  pirin domain-containing protein  38.77 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1954  Pirin-like  37.55 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0828005  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2116  pirin domain-containing protein  33.8 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0157857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2565  pirin domain-containing protein  37.55 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4570  pirin domain-containing protein  34.95 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203406  normal  0.316672 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0219  pirin  35.99 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1367  pirin domain-containing protein  37.94 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0431465 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1918  pirin domain-containing protein  36.96 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.883605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2092  Pirin domain protein  34.05 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0907  Pirin-like  38.3 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2613  pirin domain-containing protein  37.55 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1389  pirin domain-containing protein  38.3 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614726  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02280  Pirin-related protein  34.77 
 
 		 335 aa  156  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2928  pirin domain-containing protein  38.7 
 
 		 304 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4855  pirin domain-containing protein  34.78 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5897  Pirin-like protein  36.4 
 
 		 293 aa  155  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.867942  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3748  pirin domain-containing protein  34.78 
 
 		 287 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0233  Pirin domain protein  35.07 
 
 		 289 aa  155  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>