60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2701 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2701  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  433  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0546999 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3372  hypothetical protein  77.62 
 
 
228 aa  274  7e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.139512  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3925  protein of unknown function DUF161  58.18 
 
 
256 aa  246  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21650  predicted membrane protein  57.87 
 
 
238 aa  228  4e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0140026  normal  0.0791748 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0749  protein of unknown function DUF161  55.56 
 
 
234 aa  210  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.48923 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00750  predicted membrane protein  54.34 
 
 
234 aa  206  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0926  hypothetical protein  55.05 
 
 
203 aa  191  6e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.136693  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2368  protein of unknown function DUF161  51.08 
 
 
287 aa  184  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5957  hypothetical protein  50.8 
 
 
206 aa  183  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0150833  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0621  hypothetical protein  55.78 
 
 
220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2092  protein of unknown function DUF161  53.16 
 
 
214 aa  176  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.236342  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6791  protein of unknown function DUF161  52.5 
 
 
209 aa  175  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.894738  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12710  predicted membrane protein  44.93 
 
 
249 aa  174  7e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2249  protein of unknown function DUF161  51.91 
 
 
228 aa  174  9e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000534674  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4274  hypothetical protein  52.04 
 
 
295 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.734202  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0798  protein of unknown function DUF161  45.77 
 
 
213 aa  160  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.12912  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2024  protein of unknown function DUF161  49.78 
 
 
217 aa  159  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.056298  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3825  protein of unknown function DUF161  51.46 
 
 
258 aa  159  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3185  hypothetical protein  54.55 
 
 
218 aa  157  9e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.652164 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3411  hypothetical protein  54.55 
 
 
218 aa  157  9e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00640834 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1407  protein of unknown function DUF161  50.5 
 
 
244 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.593971 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3343  protein of unknown function DUF161  46.67 
 
 
219 aa  155  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.601494  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1855  hypothetical protein  53.89 
 
 
226 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1902  hypothetical protein  53.89 
 
 
226 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.58543  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1836  hypothetical protein  53.89 
 
 
226 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02390  predicted membrane protein  53.48 
 
 
209 aa  153  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.572815 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3401  protein of unknown function DUF161  54.55 
 
 
241 aa  153  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000395901  hitchhiker  0.00000885449 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2085  hypothetical protein  52.41 
 
 
233 aa  152  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1346  hypothetical protein  49.73 
 
 
224 aa  146  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4143  protein of unknown function DUF161  44.57 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.663095 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0425  protein of unknown function DUF161  41.62 
 
 
249 aa  138  7.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0290  hypothetical protein  40 
 
 
211 aa  124  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.725518  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1382  protein of unknown function DUF161  35.1 
 
 
222 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.2123e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4947  hypothetical protein  36 
 
 
225 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.89075  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2500  protein of unknown function DUF161  32.43 
 
 
218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3776  hypothetical protein  31.25 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307192  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1455  hypothetical protein  32.74 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000021666 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3755  hypothetical protein  33.93 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000625243 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3513  hypothetical protein  31.02 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3792  hypothetical protein  32.74 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3501  hypothetical protein  32.74 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3589  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3489  permease  33.33 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.487539  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3873  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3029  hypothetical protein  23.76 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.491738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3262  hypothetical protein  23.76 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0753  hypothetical protein  22.6 
 
 
306 aa  65.5  0.0000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1136  hypothetical protein  28.51 
 
 
243 aa  64.7  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.439117  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2950  permease  23.76 
 
 
221 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3273  hypothetical protein  25 
 
 
221 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134593  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3250  hypothetical protein  23.65 
 
 
222 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2000  hypothetical protein  24.44 
 
 
221 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3280  hypothetical protein  23.76 
 
 
221 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3500  hypothetical protein  27.98 
 
 
225 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0018  hypothetical protein  29.19 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1372  hypothetical protein  20.18 
 
 
214 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000743481  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1185  hypothetical protein  19.72 
 
 
214 aa  55.8  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5084  permease  20 
 
 
208 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178472  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5425  hypothetical protein  20.5 
 
 
208 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0316019  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5101  permease  20.13 
 
 
208 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>