More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0075 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0075  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 
297 aa  584  1e-166  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0619  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.66 
 
 
347 aa  389  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124261  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0958  signal recognition particle-docking protein FtsY  54.76 
 
 
400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1366  signal recognition particle-docking protein FtsY  48 
 
 
310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153394  normal  0.233761 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3698  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.94 
 
 
329 aa  278  7e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000493228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3588  recognition particle-docking protein FtsY  50.94 
 
 
329 aa  278  7e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000596157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3985  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.94 
 
 
329 aa  278  7e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000399496  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3861  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.94 
 
 
329 aa  278  7e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.12258e-60 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2372  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.16 
 
 
320 aa  277  1e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3767  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.64 
 
 
320 aa  278  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000377729  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3889  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.56 
 
 
329 aa  276  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141738  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1294  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.44 
 
 
416 aa  276  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000563395  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1319  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.44 
 
 
416 aa  276  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025253  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3606  recognition particle-docking protein  50.56 
 
 
329 aa  276  4e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000396319  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3670  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.44 
 
 
329 aa  275  8e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000567512  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3946  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.44 
 
 
329 aa  275  9e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.93 
 
 
340 aa  275  9e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3895  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.56 
 
 
329 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1297  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.44 
 
 
329 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000242515  hitchhiker  2.59158e-22 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2499  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.44 
 
 
329 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00080713  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1085  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.95 
 
 
329 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131602  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0801  cell division protein FtsY  44.48 
 
 
408 aa  273  3e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0242269  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0777  Signal recognition particle GTPase-like protein  48.91 
 
 
305 aa  273  4.0000000000000004e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.221787  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0151  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.97 
 
 
317 aa  272  5.000000000000001e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  46.52 
 
 
350 aa  271  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1184  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.14 
 
 
312 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000333894  normal  0.0338709 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1976  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.81 
 
 
328 aa  269  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.26 
 
 
494 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0776  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.74 
 
 
314 aa  268  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.93 
 
 
351 aa  267  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.8 
 
 
373 aa  267  1e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3524  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.54 
 
 
320 aa  266  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  43.75 
 
 
471 aa  267  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2442  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.19 
 
 
310 aa  267  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000126668  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0099  cell division protein FtsY  43.42 
 
 
495 aa  266  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13548  recognition particle-docking protein FtsY  45.51 
 
 
317 aa  266  2.9999999999999995e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.93 
 
 
497 aa  265  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.1 
 
 
326 aa  265  8.999999999999999e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3877  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.22 
 
 
432 aa  265  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3090  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.15 
 
 
320 aa  263  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.0202062 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.37 
 
 
453 aa  263  3e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.28 
 
 
510 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2067  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.12 
 
 
309 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959159  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.93 
 
 
514 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.52 
 
 
342 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0926  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.66 
 
 
302 aa  261  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.183665  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4751  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  43.09 
 
 
505 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.974367  normal  0.0527316 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.09 
 
 
452 aa  260  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2142  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.97 
 
 
320 aa  260  2e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0288315  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0427  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.09 
 
 
513 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2354  cell division membrane protein  46.9 
 
 
472 aa  259  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000763762  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1715  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.6 
 
 
319 aa  259  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0121805  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.67 
 
 
481 aa  259  4e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0573  hypothetical protein  45.42 
 
 
311 aa  259  4e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0718  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.95 
 
 
465 aa  258  6e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.073476  hitchhiker  0.00719996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3700  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.23 
 
 
377 aa  258  6e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.281966 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4980  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.97 
 
 
317 aa  258  7e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.75 
 
 
501 aa  258  8e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1563  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.33 
 
 
442 aa  258  1e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1718  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.04 
 
 
381 aa  257  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000392089  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0221  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.55 
 
 
535 aa  256  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359451  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3942  cell division protein FtsY  45.6 
 
 
491 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0697  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.25 
 
 
302 aa  256  4e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0640674  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  42.95 
 
 
541 aa  255  5e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3840  cell division protein FtsY  45.6 
 
 
491 aa  254  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3773  cell division protein FtsY  45.6 
 
 
491 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.83 
 
 
485 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3763  cell division protein FtsY  45.6 
 
 
491 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1001  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.01 
 
 
397 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000041577  hitchhiker  0.00000536863 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3883  cell division protein FtsY  45.6 
 
 
491 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.629527  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.05 
 
 
375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0414  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.31 
 
 
447 aa  253  2.0000000000000002e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03313  fused Signal Recognition Particle (SRP) receptor: membrane binding protein/conserved protein  45.1 
 
 
498 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0251  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.1 
 
 
497 aa  253  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0252  cell division protein FtsY  45.1 
 
 
498 aa  253  3e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3663  cell division protein FtsY  45.1 
 
 
498 aa  253  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1555  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.15 
 
 
295 aa  253  3e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03266  hypothetical protein  45.1 
 
 
498 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3747  cell division protein FtsY  45.1 
 
 
512 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0239  cell division protein FtsY  44.22 
 
 
541 aa  253  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0752366  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0577  cell division protein  44.22 
 
 
553 aa  252  4.0000000000000004e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3946  cell division protein FtsY  44.77 
 
 
497 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4784  cell division protein FtsY  45.1 
 
 
498 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1170  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.17 
 
 
301 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.102852  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3979  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.22 
 
 
523 aa  252  5.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2903  cell division protein FtsY  43.32 
 
 
410 aa  252  6e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.297557  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3686  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.43 
 
 
331 aa  252  6e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.915822  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48100  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.93 
 
 
451 aa  252  7e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0287334  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0277  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.43 
 
 
546 aa  251  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3858  cell division protein FtsY  45.1 
 
 
497 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0707  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.86 
 
 
469 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.438751  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  42.28 
 
 
362 aa  250  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3868  cell division protein FtsY  44.95 
 
 
511 aa  250  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.046763  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.07 
 
 
405 aa  250  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00280  signal recognition particle GTPase  43 
 
 
408 aa  249  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0934  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.52 
 
 
478 aa  249  3e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000272201  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0708  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.86 
 
 
469 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1399  signal recognition particle receptor (docking protein)  44.67 
 
 
463 aa  249  3e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0283882  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1481  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.52 
 
 
477 aa  249  4e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0171168  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0673  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.39 
 
 
444 aa  248  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.191674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>