More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4231 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4231  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  100 
 
 		 258 aa  521  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.503556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4434  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  89.53 
 
 		 258 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4120  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  88.37 
 
 		 258 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0274  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  87.98 
 
 		 258 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2192  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  82.17 
 
 		 258 aa  440  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3829  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  76.59 
 
 		 266 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.179517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5844  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  76.19 
 
 		 264 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0758  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  76.19 
 
 		 272 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850324  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1312  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  75 
 
 		 265 aa  381  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4093  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  75.79 
 
 		 266 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0806703 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1282  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  75.79 
 
 		 262 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.328087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0817  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  71.83 
 
 		 257 aa  368  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2910  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  72.51 
 
 		 257 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.838485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3699  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  71.26 
 
 		 256 aa  365  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.493547 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4211  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  71.83 
 
 		 256 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637449  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3332  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  69.69 
 
 		 284 aa  362  4e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2919  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  69.96 
 
 		 262 aa  362  4e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0502891  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6094  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.7 
 
 		 263 aa  361  6e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991353  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3852  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  72.51 
 
 		 257 aa  361  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2961  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.25 
 
 		 257 aa  358  5e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.919043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2882  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  69.53 
 
 		 269 aa  358  6e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.769928  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2563  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  69.02 
 
 		 273 aa  354  8.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641397  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4778  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  70.54 
 
 		 260 aa  353  1e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.326884  normal  0.35491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2255  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  69.17 
 
 		 273 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000530025  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1753  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  69.96 
 
 		 271 aa  350  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0517  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.8 
 
 		 262 aa  348  6e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20400  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  69.17 
 
 		 271 aa  346  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110651  normal  0.49891 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0891  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.45 
 
 		 254 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0301  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.77 
 
 		 251 aa  342  2.9999999999999997e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0762  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.76 
 
 		 258 aa  342  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000264723  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03969  carbon-phosphorus lyase complex subunit  67.59 
 
 		 252 aa  340  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3894  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.59 
 
 		 252 aa  340  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3929  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.59 
 
 		 252 aa  340  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03929  hypothetical protein  67.59 
 
 		 252 aa  340  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4651  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.59 
 
 		 252 aa  340  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4338  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.59 
 
 		 252 aa  340  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5610  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.59 
 
 		 252 aa  340  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4563  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.59 
 
 		 252 aa  339  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3698  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.8 
 
 		 263 aa  338  4e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4027  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.8 
 
 		 263 aa  338  4e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2690  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.59 
 
 		 273 aa  338  7e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3564  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.8 
 
 		 262 aa  338  7e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1312  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.92 
 
 		 262 aa  336  2.9999999999999997e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0709875  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0483  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.48 
 
 		 262 aa  333  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0579  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.71 
 
 		 262 aa  331  8e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4190  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.15 
 
 		 258 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2183  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.06 
 
 		 256 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.481502  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5944  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.06 
 
 		 256 aa  325  5e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.504755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3777  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.49 
 
 		 256 aa  318  6e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0141  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.53 
 
 		 294 aa  316  3e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662097  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1181  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.53 
 
 		 256 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3307  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.53 
 
 		 256 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3341  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.53 
 
 		 256 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.489996  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2590  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.53 
 
 		 256 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2404  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.14 
 
 		 256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0320  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.14 
 
 		 256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3353  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  63.53 
 
 		 611 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403888  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2915  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  60.16 
 
 		 254 aa  287  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1929  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  56.47 
 
 		 260 aa  286  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2282  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  56.47 
 
 		 260 aa  286  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4041  ABC transporter related  48.58 
 
 		 276 aa  232  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0221  ABC transporter related  48.58 
 
 		 276 aa  232  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2086  ABC transporter related  46.56 
 
 		 278 aa  228  5e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5001  ABC transporter related  44.77 
 
 		 276 aa  227  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.20285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3688  ABC transporter for phosphonate ATP-binding protein  46.56 
 
 		 278 aa  226  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4145  ABC transporter related  48.58 
 
 		 276 aa  224  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2293  ABC transporter related  47.77 
 
 		 276 aa  221  6e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0428  ABC type ATPase  48.19 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.602427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0464  ABC type ATPase  48.19 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.849392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3839  ABC transporter related  46.67 
 
 		 276 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.588878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3788  ABC transporter related  46.67 
 
 		 276 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1587  ABC transporter related  48.33 
 
 		 280 aa  218  7e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2292  ABC phosphonate transport system ATPase  46.56 
 
 		 276 aa  215  5e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3508  ABC transporter related  47.08 
 
 		 279 aa  215  7e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0232  ABC transporter related  43.5 
 
 		 286 aa  205  5e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5869  ABC transporter-related protein  46.47 
 
 		 291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  40.77 
 
 		 593 aa  169  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  40.38 
 
 		 593 aa  169  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  40.38 
 
 		 601 aa  166  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  39.03 
 
 		 568 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1341  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  36.78 
 
 		 349 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0620  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.74 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.746851  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0549  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.74 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  34.63 
 
 		 575 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0111  dipeptide transporter ATP-binding subunit  36.76 
 
 		 322 aa  155  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.22 
 
 		 548 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.98 
 
 		 623 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2851  ABC transporter related  36.84 
 
 		 310 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.148442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  36.67 
 
 		 543 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  35.41 
 
 		 619 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  34.87 
 
 		 623 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14270  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.45 
 
 		 577 aa  153  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0918  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.88 
 
 		 677 aa  153  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.233334 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18750  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  40.16 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0962  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.95 
 
 		 322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000380465 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0678  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.56 
 
 		 445 aa  152  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106585  normal  0.159459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2128  ATP-binding protein of oligopeptide ABC transporter  39.85 
 
 		 345 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3166  ABC transporter related protein  38.98 
 
 		 516 aa  152  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  34.48 
 
 		 623 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0320  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.13 
 
 		 322 aa  152  7e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.173398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>