More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4078 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_4078  methyltransferase type 11  100 
 
 
259 aa  525  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1222  methyltransferase  40.75 
 
 
272 aa  184  9e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.328239  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2026  Methyltransferase type 11  38.31 
 
 
261 aa  165  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508606  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2248  Methyltransferase type 11  36.96 
 
 
261 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.586689  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4417  methyltransferase type 11  40 
 
 
269 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.587336 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1358  methyltransferase type 11  39.15 
 
 
271 aa  156  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.2 
 
 
250 aa  148  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 
253 aa  138  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0198  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.06 
 
 
252 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.537911  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  31.62 
 
 
257 aa  130  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1279  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.29 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.48 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  30.95 
 
 
262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.97 
 
 
253 aa  125  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  34.72 
 
 
226 aa  125  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.17 
 
 
259 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  38.85 
 
 
226 aa  121  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  32.24 
 
 
226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  28.81 
 
 
248 aa  109  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  32.18 
 
 
210 aa  107  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.58 
 
 
250 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  30.73 
 
 
244 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  30 
 
 
230 aa  99.8  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  37.06 
 
 
225 aa  98.6  8e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0352  Methyltransferase type 11  45.08 
 
 
249 aa  98.6  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.55 
 
 
250 aa  97.4  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  34.93 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0474  hypothetical protein  31.55 
 
 
252 aa  92.8  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  32.34 
 
 
258 aa  92  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0342  Methyltransferase type 11  34.9 
 
 
252 aa  92  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  46.15 
 
 
257 aa  91.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.94 
 
 
263 aa  91.3  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2984  methyltransferase type 11  39.86 
 
 
227 aa  89.7  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 
265 aa  87.4  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.3 
 
 
155 aa  87.8  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  49.48 
 
 
225 aa  85.1  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0720  hypothetical protein  28.11 
 
 
234 aa  82  0.000000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  48.62 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0543  Methyltransferase type 11  30.58 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.5 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  38.81 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  36.43 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  39.64 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.9 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2016  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.26 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7094  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.84 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000661752  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.4 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.29 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.54 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3792  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.72 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.72 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.17 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179927  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.72 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 
624 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1652  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.73 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.583368 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001927  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE/COQ5  31.58 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.34 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  37.09 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  37.09 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3373  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.66 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0387  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.35 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00562  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.81 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.04 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  32.96 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3415  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.5 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0103  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.38 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.881721  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  28.79 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.330514 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3915  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.11 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  40.35 
 
 
342 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1769  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1849  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  38.26 
 
 
283 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3658  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.55 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  7.70132e-21 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4247  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.8 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225644  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4209  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  37.5 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0746  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.18 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4421  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.32 
 
 
236 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6252  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.43 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.015779 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0506  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.71 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5061  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.84 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 
240 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  39.47 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  30.43 
 
 
258 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.71 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.47 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0713  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  32.78 
 
 
374 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.919448  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3089  putative methyltransferase  43.14 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3945  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.36 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3895  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.71 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.4649  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2107  methyltransferase type 11  36.19 
 
 
273 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4115  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  28.89 
 
 
212 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0445  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.71 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187756  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0454  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.84 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0799871  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.36 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0431  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.71 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159062  hitchhiker  0.0000667 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0271  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.36 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4056  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.04 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1234  hypothetical protein  28.45 
 
 
524 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0873345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>