More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2219 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2219  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  288  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.457573 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2680  protein of unknown function UPF0047  77.14 
 
 		 140 aa  234  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2940  protein of unknown function UPF0047  76.98 
 
 		 140 aa  233  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1467  hypothetical protein  78.99 
 
 		 144 aa  232  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3095  hypothetical protein  74.6 
 
 		 126 aa  211  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0121064  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2128  hypothetical protein  67.18 
 
 		 140 aa  191  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.594367  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2137  hypothetical protein  58.99 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.435583  normal  0.930073 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2258  hypothetical protein  57.78 
 
 		 139 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.479021 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4069  hypothetical protein  52.17 
 
 		 141 aa  166  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.491688  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1302  protein of unknown function UPF0047  54.01 
 
 		 139 aa  161  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0627  hypothetical protein  54.17 
 
 		 166 aa  160  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299074  decreased coverage  0.00428994 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1542  protein of unknown function UPF0047  52.41 
 
 		 166 aa  159  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1124  hypothetical protein  58.65 
 
 		 140 aa  157  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1587  hypothetical protein  55 
 
 		 139 aa  155  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.185989  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0099  hypothetical protein  55 
 
 		 139 aa  155  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426584  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0104  hypothetical protein  55 
 
 		 139 aa  155  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5144  hypothetical protein  56.93 
 
 		 139 aa  156  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0131  hypothetical protein  55 
 
 		 139 aa  155  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3983  hypothetical protein  54.89 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000000552293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  55.47 
 
 		 138 aa  154  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  55.47 
 
 		 138 aa  154  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2851  protein of unknown function UPF0047  58.46 
 
 		 140 aa  154  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  57.14 
 
 		 160 aa  154  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2118  protein of unknown function UPF0047  54.89 
 
 		 139 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1451  hypothetical protein  55.56 
 
 		 157 aa  153  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5223  hypothetical protein  54.89 
 
 		 139 aa  152  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0643  protein of unknown function UPF0047  56.39 
 
 		 142 aa  150  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5282  protein of unknown function UPF0047  54.89 
 
 		 139 aa  150  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4457  hypothetical protein  51.47 
 
 		 138 aa  150  5e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  56.62 
 
 		 160 aa  150  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3301  hypothetical protein  55.64 
 
 		 139 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0121064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4874  hypothetical protein  51.82 
 
 		 137 aa  149  8.999999999999999e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903926  hitchhiker  0.00000135956 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2889  hypothetical protein  54.01 
 
 		 139 aa  148  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0078  hypothetical protein  49.3 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1335  hypothetical protein  53.38 
 
 		 140 aa  148  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.970106  decreased coverage  0.00476745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0850  hypothetical protein  54.48 
 
 		 155 aa  148  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.719995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  53.68 
 
 		 160 aa  147  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0081  protein of unknown function UPF0047  53.38 
 
 		 139 aa  146  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0686334  normal  0.0165253 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  52.94 
 
 		 160 aa  146  9e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4149  hypothetical protein  53.28 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4801  hypothetical protein  53.28 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639835  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3367  hypothetical protein  53.28 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00750068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2190  hypothetical protein  48.12 
 
 		 139 aa  143  9e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1273  protein of unknown function UPF0047  52.21 
 
 		 138 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1762  hypothetical protein  53.38 
 
 		 142 aa  141  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2407  hypothetical protein  48.53 
 
 		 137 aa  140  7e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2820  hypothetical protein  51.09 
 
 		 144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6559  protein of unknown function UPF0047  52.63 
 
 		 143 aa  138  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.552252  normal  0.186603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  51.59 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0889  protein of unknown function UPF0047  51.16 
 
 		 143 aa  134  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0742  conserved hypothetical protein TIGR00149  51.16 
 
 		 143 aa  134  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1102  hypothetical protein  51.47 
 
 		 139 aa  133  8e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0834  hypothetical protein  52.03 
 
 		 157 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0564298 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1293  hypothetical protein  50.74 
 
 		 140 aa  132  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0632  hypothetical protein  46.32 
 
 		 139 aa  130  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1880  hypothetical protein  51.49 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4567  hypothetical protein  51.64 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0918  protein of unknown function UPF0047  52.85 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1691  hypothetical protein  42.75 
 
 		 138 aa  122  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00156174  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1152  protein of unknown function UPF0047  46.27 
 
 		 139 aa  119  9e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.916503  hitchhiker  0.00000047058 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04921  hypothetical protein  37.96 
 
 		 212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0925424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1688  hypothetical protein  45.11 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1264  hypothetical cytosolic protein  44.29 
 
 		 150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1322  hypothetical protein  43.66 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0674  hypothetical protein  44.36 
 
 		 205 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.798458  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05561  hypothetical protein  40.29 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05491  hypothetical protein  37.86 
 
 		 153 aa  114  5e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.985204  normal  0.552245 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0267  hypothetical protein  51.64 
 
 		 141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.508397  normal  0.204565 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2384  hypothetical protein  40.88 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1665  hypothetical protein  47.01 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3510  hypothetical protein  52.43 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2403  protein of unknown function UPF0047  43.8 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1703  protein of unknown function UPF0047  53.77 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0527  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  43.7 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1825  hypothetical protein  37.14 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1262  protein of unknown function UPF0047  43.57 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2217  hypothetical protein  49.52 
 
 		 139 aa  111  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  hitchhiker  0.001424 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00014  hypothetical protein  42.45 
 
 		 159 aa  111  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2650  hypothetical protein  45.93 
 
 		 139 aa  110  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002339  hypothetical protein  42.45 
 
 		 148 aa  110  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0261  hypothetical protein  54.9 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2351  hypothetical protein  50.42 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0140381  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0219  hypothetical protein  53.92 
 
 		 141 aa  110  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32835  conserved hypothetical protein  41.3 
 
 		 147 aa  110  6e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.805601  normal  0.755477 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0725  protein of unknown function UPF0047  53.33 
 
 		 141 aa  110  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2246  protein of unknown function UPF0047  50.44 
 
 		 140 aa  110  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0188  hypothetical protein  52.83 
 
 		 141 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49270  predicted protein  48.18 
 
 		 154 aa  110  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5528  protein of unknown function UPF0047  40.15 
 
 		 140 aa  110  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.652918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07151  hypothetical protein  40.58 
 
 		 156 aa  110  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3660  protein of unknown function UPF0047  44.85 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180865  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5504  hypothetical protein  44.44 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1889  protein of unknown function UPF0047  45.93 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0249  hypothetical protein  41.04 
 
 		 145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00650906  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4360  hypothetical protein  42.54 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0493  hypothetical protein  39.26 
 
 		 151 aa  107  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0896666  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6028  hypothetical protein  44.78 
 
 		 141 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05481  hypothetical protein  40 
 
 		 151 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.339637  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2784  hypothetical protein  46.03 
 
 		 139 aa  106  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00159172  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47770  hypothetical protein  51.96 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>