123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0036 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0036  protein of unknown function DUF124  100 
 
 
338 aa  685    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0214903  hitchhiker  0.0000202128 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03595  hypothetical protein  74.78 
 
 
336 aa  448  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3113  hypothetical protein  58.28 
 
 
327 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1709  hypothetical protein  64.75 
 
 
277 aa  347  1e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0814  hypothetical protein  65.65 
 
 
291 aa  341  8e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0947  hypothetical protein  68.03 
 
 
244 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0049  hypothetical protein  62.12 
 
 
263 aa  333  2e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3272  hypothetical protein  64.98 
 
 
275 aa  327  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1656  hypothetical protein  61.69 
 
 
266 aa  326  4.0000000000000003e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0812  protein of unknown function DUF124  61.9 
 
 
267 aa  317  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2218  hypothetical protein  63.6 
 
 
270 aa  315  6e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0491928  normal  0.970799 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3337  hypothetical protein  62.4 
 
 
272 aa  306  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08951  hypothetical protein  57.3 
 
 
267 aa  305  8.000000000000001e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0564  protein of unknown function DUF124  59.32 
 
 
264 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2361  hypothetical protein  59.55 
 
 
264 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000120346  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2289  hypothetical protein  59.18 
 
 
264 aa  296  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000396788  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2479  hypothetical protein  59.18 
 
 
264 aa  295  6e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00285287  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1146  protein of unknown function DUF124  57.14 
 
 
261 aa  295  7e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000459152  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1966  hypothetical protein  58.8 
 
 
264 aa  293  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0692  hypothetical protein  54.22 
 
 
267 aa  293  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1673  hypothetical protein  58.43 
 
 
264 aa  292  6e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.095515  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2613  hypothetical protein  58.05 
 
 
264 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000175451  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2726  hypothetical protein  58.05 
 
 
264 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.260895  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2651  hypothetical protein  57.68 
 
 
264 aa  289  6e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.203413  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1571  hypothetical protein  57.79 
 
 
264 aa  288  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.005738  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1734  protein of unknown function DUF124  57.68 
 
 
264 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.929674  hitchhiker  0.00192382 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1108  hypothetical protein  52.47 
 
 
262 aa  281  8.000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5020  hypothetical protein  57.14 
 
 
260 aa  276  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5002  hypothetical protein  57.14 
 
 
260 aa  276  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4991  hypothetical protein  57.14 
 
 
260 aa  276  4e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.012605  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4615  hypothetical protein  57.14 
 
 
263 aa  275  6e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000211636  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4702  hypothetical protein  56.75 
 
 
260 aa  275  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00413063  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4593  hypothetical protein  57.14 
 
 
260 aa  275  8e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00756177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4973  hypothetical protein  57.14 
 
 
260 aa  275  8e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2324  hypothetical protein  53.76 
 
 
262 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.42555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0247  hypothetical protein  55.56 
 
 
260 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00113613  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0312  hypothetical protein  55.34 
 
 
265 aa  268  8.999999999999999e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0318  hypothetical protein  54.96 
 
 
265 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0683  hypothetical protein  51.85 
 
 
259 aa  267  2e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0422401  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2160  hypothetical protein  54.69 
 
 
264 aa  264  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4264  protein of unknown function DUF124  49.04 
 
 
259 aa  259  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.191522 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4893  protein of unknown function DUF124  48.67 
 
 
259 aa  259  6e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16590  hypothetical protein  56.9 
 
 
248 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1442  hypothetical protein  56.49 
 
 
248 aa  245  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3366  hypothetical protein  52.61 
 
 
248 aa  238  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113587  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0969  hypothetical protein  52.08 
 
 
262 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4755  hypothetical protein  55.71 
 
 
226 aa  229  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5116  hypothetical protein  55.71 
 
 
226 aa  229  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.197425  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39350  hypothetical protein  51 
 
 
248 aa  229  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.805149  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2602  protein of unknown function DUF124  49.6 
 
 
256 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3109  hypothetical protein  51.03 
 
 
242 aa  222  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1909  protein of unknown function DUF124  50.85 
 
 
234 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000612078 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1826  hypothetical protein  47.52 
 
 
253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.768491  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0253  hypothetical protein  46.55 
 
 
233 aa  203  3e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.485303  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0972  hypothetical protein  40.82 
 
 
251 aa  200  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3626  protein of unknown function DUF124  42.97 
 
 
316 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.56616  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4353  hypothetical protein  42.53 
 
 
340 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1861  hypothetical protein  41.95 
 
 
228 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4068  hypothetical protein  45.71 
 
 
253 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1202  hypothetical protein  45.71 
 
 
253 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3709  hypothetical protein  45.71 
 
 
319 aa  175  8e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0906247  hitchhiker  0.000000182656 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3221  hypothetical protein  45.31 
 
 
269 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_5132  predicted protein  37.87 
 
 
225 aa  175  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355992  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2078  protein of unknown function DUF124  40.74 
 
 
229 aa  169  8e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3851  predicted protein  36.68 
 
 
218 aa  164  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0845  hypothetical protein  37.82 
 
 
224 aa  144  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.42306  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1941  protein of unknown function DUF124  38.33 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2565  protein of unknown function DUF124  34.18 
 
 
232 aa  137  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0893  hypothetical protein  32.1 
 
 
230 aa  132  6.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1587  protein of unknown function DUF124  39.47 
 
 
254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215755  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0472  hypothetical protein  34.23 
 
 
238 aa  122  6e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000159087  normal  0.0186431 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0898  hypothetical protein  38.12 
 
 
224 aa  118  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45623  predicted protein  32.78 
 
 
259 aa  116  6e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45622  predicted protein  29.15 
 
 
305 aa  114  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.885288  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45624  predicted protein  29.96 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.322694  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1337  hypothetical protein  30.84 
 
 
224 aa  108  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1446  hypothetical protein  33.33 
 
 
246 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2433  hypothetical protein  32.81 
 
 
247 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428414  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2257  protein of unknown function DUF124  35.41 
 
 
240 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.518189  normal  0.805361 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1430  protein of unknown function DUF124  32.95 
 
 
247 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.166696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1525  protein of unknown function DUF124  32.95 
 
 
247 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1244  hypothetical protein  34.39 
 
 
231 aa  102  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156362  normal  0.0947193 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0565  hypothetical protein  34.29 
 
 
225 aa  101  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000124544  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0551  hypothetical protein  34.45 
 
 
225 aa  100  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000146225  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1074  protein of unknown function DUF124  30.17 
 
 
223 aa  99.8  6e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0322  protein of unknown function DUF124  32.39 
 
 
235 aa  96.7  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.038985  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0457  hypothetical protein  30.77 
 
 
220 aa  95.9  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1500  hypothetical protein  33.65 
 
 
231 aa  94.4  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0203519  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0344  hypothetical protein  32.7 
 
 
227 aa  93.2  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3312  protein of unknown function DUF124  36.29 
 
 
263 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39292  predicted protein  29.3 
 
 
243 aa  90.9  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.240986  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1044  protein of unknown function DUF124  33.18 
 
 
228 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0982  hypothetical protein  30.49 
 
 
222 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0459  hypothetical protein  26.29 
 
 
349 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0268  hypothetical protein  30.04 
 
 
222 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3326  protein of unknown function DUF124  33.04 
 
 
225 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561063  normal  0.199232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5374  protein of unknown function DUF124  33.77 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34470  conserved hypothetical protein TIGR00266  31.05 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.911046  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1496  hypothetical protein  27.5 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.96996  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0069  protein of unknown function DUF124  30.19 
 
 
232 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.770139 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>