62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3827 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3827  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  601  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.361007  normal  0.969458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0220  hypothetical protein  51.88 
 
 		 292 aa  322  4e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0893  beta-lactamase domain-containing protein  32.22 
 
 		 278 aa  135  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0178503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0063  ribonuclease Z  32.05 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.253794  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0063  ribonuclease Z  31.66 
 
 		 280 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.715887  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1423  beta-lactamase domain-containing protein  30.5 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.408877  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0562  beta-lactamase domain-containing protein  26 
 
 		 275 aa  90.5  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.146612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2725  ribonuclease Z family protein  30.88 
 
 		 290 aa  90.1  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.399344  normal  0.100634 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2995  Nuz  25.72 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.234829  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26345  predicted protein  32.09 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  27.24 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  27.72 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1914  ribonuclease Z  28.27 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.552811  normal  0.18224 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  24.61 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0727  ribonuclease Z  25.78 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.176511  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  25.19 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_002620  TC0625  ribonuclease Z  26.45 
 
 		 304 aa  53.5  0.000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  23.18 
 
 		 306 aa  52.4  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1866  beta-lactamase domain protein  26.95 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  26.96 
 
 		 328 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10313  ribonuclease Z  28.33 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0874  beta-lactamase superfamily hydrolase  25.78 
 
 		 309 aa  50.4  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519626 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4543  ribonuclease Z  26.77 
 
 		 301 aa  50.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  26.77 
 
 		 309 aa  50.4  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1723  ribonuclease Z  26.77 
 
 		 287 aa  49.3  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00214675  decreased coverage  0.00000691229 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0405  beta-lactamase domain-containing protein  25.68 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.945649  normal  0.820015 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2837  ribonuclease Z  23.97 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  25 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1749  ribonuclease Z  27.16 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86123  predicted protein  40.54 
 
 		 780 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389885  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  26.04 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  27.16 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  25.93 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4676  cyclic-AMP phosphodiesterase  27.33 
 
 		 263 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1592  ribonuclease Z  22.64 
 
 		 306 aa  46.6  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359546  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1561  ribonuclease Z  22.64 
 
 		 306 aa  46.6  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1103  RNAse Z  27.24 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0696  ribonuclease Z  24.9 
 
 		 316 aa  46.2  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  23.67 
 
 		 315 aa  46.2  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  25.56 
 
 		 291 aa  45.8  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3410  ribonuclease Z  23.19 
 
 		 311 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2424  ribonuclease Z  22.99 
 
 		 311 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.94801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11850  predicted protein  23.26 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0010  ribonuclease Z  25.47 
 
 		 304 aa  45.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1389  ribonuclease BN  23.19 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471365  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02195  ribonuclease Z  23.19 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02154  hypothetical protein  23.19 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.871793  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2647  ribonuclease Z  23.19 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.313305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1380  ribonuclease Z  23.19 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2565  ribonuclease Z  23.19 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.848275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2414  ribonuclease Z  23.19 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47120  predicted protein  35.14 
 
 		 748 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0739  ribonuclease Z  22.7 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0738  ribonuclease Z  26.72 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  24.65 
 
 		 291 aa  43.5  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  25.59 
 
 		 318 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1526  ribonuclease Z  25.09 
 
 		 318 aa  42.7  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00811682  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08200  ribonuclease Z  25.66 
 
 		 306 aa  42.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.444748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0984  cyclic-AMP phosphodiesterase  41.27 
 
 		 254 aa  42.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2672  beta-lactamase domain protein  26.15 
 
 		 320 aa  42.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.162319 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3358  Beta-lactamase-like  31.76 
 
 		 255 aa  42.4  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4169  ribonuclease Z  23.22 
 
 		 314 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.406356  normal  0.0568624 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>