More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1712 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 
829 aa  703  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1254  leucyl-tRNA synthetase  56.43 
 
 
922 aa  1101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39550  leucyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 
949 aa  724  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990256  normal  0.390992 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3901  leucyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 
1064 aa  695  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0952  leucyl-tRNA synthetase  55.06 
 
 
1146 aa  733  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3451  leucyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 
952 aa  746  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12550  leucyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
985 aa  695  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.220072  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1568  leucyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
984 aa  719  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.609969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0829  leucyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 
1016 aa  696  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5765  leucyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 
971 aa  743  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351208  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5392  leucyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 
978 aa  727  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6458  leucyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 
854 aa  721  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4829  leucyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 
951 aa  758  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.304554  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7074  leucyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 
934 aa  768  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6801  leucyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 
958 aa  763  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3538  leucyl-tRNA synthetase  67.79 
 
 
936 aa  1360  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
833 aa  754  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1363  leucyl-tRNA synthetase  55.53 
 
 
923 aa  1136  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0328  leucyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 
987 aa  735  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17360  leucyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 
984 aa  710  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634909  normal  0.0124443 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1287  leucyl-tRNA synthetase  61.58 
 
 
921 aa  1252  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.242192  normal  0.752482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 
971 aa  742  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6054  leucyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 
968 aa  737  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110636  normal  0.47008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5389  leucyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 
971 aa  742  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852911  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0635  leucyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
808 aa  636  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1730  leucyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 
968 aa  702  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.749966  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2339  leucyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 
838 aa  733  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.476002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0201  leucyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 
835 aa  693  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2634  leucyl-tRNA synthetase  70.2 
 
 
969 aa  1434  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0671  leucyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 
906 aa  794  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0853  leucyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
949 aa  741  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0292771 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4914  leucyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 
950 aa  757  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.782007 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04530  leucyl-tRNA synthetase  57.84 
 
 
944 aa  1138  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4214  leucyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 
952 aa  724  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0796  leucyl-tRNA synthetase  58.76 
 
 
925 aa  1146  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2234  leucyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 
982 aa  721  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0120653 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 
833 aa  729  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0565  leucyl-tRNA synthetase  57.77 
 
 
954 aa  1123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.352137  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3733  leucyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
936 aa  796  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0244486  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10040  leucyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 
969 aa  712  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.928861 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3367  leucyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 
963 aa  711  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737021  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3225  leucyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
954 aa  754  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14755  normal  0.0283865 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1712  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
949 aa  1972  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837375  normal  0.849359 
 
 
-
 
NC_002620  TC0481  leucyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 
819 aa  699  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.772871  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2223  leucyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 
990 aa  694  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0944  leucine--tRNA ligase  39.9 
 
 
994 aa  726  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13250  leucyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 
978 aa  686  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
804 aa  630  1e-179  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0386  leucyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 
802 aa  625  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 
802 aa  621  1e-176  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4875  leucyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 
802 aa  621  1e-176  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4851  leucyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 
802 aa  621  1e-176  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36273  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 
802 aa  619  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 
802 aa  617  1e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1654  leucyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 
857 aa  617  1e-175  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.119933 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 
802 aa  617  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4861  leucyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 
802 aa  617  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 
802 aa  617  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 
802 aa  617  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  49.77 
 
 
806 aa  599  1e-170  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  2.79205e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  50.55 
 
 
805 aa  599  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 
858 aa  602  1e-170  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  50.55 
 
 
805 aa  599  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4570  leucyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 
802 aa  593  1e-168  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2764  leucyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 
805 aa  595  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000658086  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2882  leucyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 
856 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0606181  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56599  predicted protein  46.5 
 
 
899 aa  589  1e-167  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41128  predicted protein  41.78 
 
 
879 aa  592  1e-167  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.780375  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3236  leucyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
856 aa  588  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0839  leucyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 
829 aa  584  1e-165  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.435731  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0666  leucyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 
805 aa  583  1e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0257  leucyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 
840 aa  565  1e-159  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.847152  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0598  leucyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 
805 aa  565  1e-159  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0551  leucyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
816 aa  561  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2055  leucyl-tRNA synthetase  35.32 
 
 
853 aa  558  1e-157  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1033  leucyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 
875 aa  550  1e-155  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf171  leucyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 
804 aa  552  1e-155  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1074  leucyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 
875 aa  548  1e-154  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.902773 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0665  leucyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
807 aa  546  1e-154  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 
865 aa  547  1e-154  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0380  leucyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 
806 aa  547  1e-154  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0938  leucyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 
807 aa  547  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0077  leucyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 
904 aa  549  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.622899  hitchhiker  8.64885e-05 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01222  leucyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 
862 aa  544  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1636  leucyl-tRNA synthetase  45 
 
 
805 aa  544  1e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.494326  normal  0.491966 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0425  leucyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
801 aa  543  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004217  leucyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 
857 aa  544  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  8.07673e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0479  leucyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 
877 aa  533  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2344  leucyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 
856 aa  530  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.633045  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15061  leucyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 
878 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136372 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0232  leucyl-tRNA synthetase  34.06 
 
 
861 aa  526  1e-148  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0659  leucyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 
804 aa  528  1e-148  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3868  leucyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
857 aa  523  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0511  leucyl-tRNA synthetase  33.54 
 
 
866 aa  523  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4812  leucyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 
868 aa  525  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0432  leucyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 
859 aa  524  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0302206  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl490  leucyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 
801 aa  523  1e-147  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2744  leucyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 
864 aa  523  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0478  leucyl-tRNA synthetase  34.96 
 
 
894 aa  520  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0284  leucyl-tRNA synthetase  34.35 
 
 
882 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.366179  normal  0.453958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>