More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30660 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  100 
 
 		 466 aa  915    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3159  general substrate transporter  73.09 
 
 		 428 aa  587  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.761686  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4675  major facilitator transporter  70 
 
 		 628 aa  587  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85896  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1314  General substrate transporter  64.06 
 
 		 470 aa  555  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012233 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1269  general substrate transporter  63.47 
 
 		 470 aa  548  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2295  major facilitator superfamily MFS_1  64.43 
 
 		 452 aa  534  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3923  major facilitator superfamily MFS_1  59.23 
 
 		 452 aa  476  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05660  metabolite-proton symporter  56.22 
 
 		 482 aa  473  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  58.85 
 
 		 463 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  58.85 
 
 		 463 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  58.85 
 
 		 463 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11030  Sugar (and other) transporter  57.17 
 
 		 472 aa  461  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.267916  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0860  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  54.59 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0644  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  54.36 
 
 		 442 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3427  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  55.06 
 
 		 441 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3302  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  55.08 
 
 		 444 aa  436  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4745  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  55.35 
 
 		 440 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3920  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  55.56 
 
 		 440 aa  423  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.210524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  55.45 
 
 		 447 aa  424  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  48.55 
 
 		 436 aa  414  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0190  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  55.35 
 
 		 440 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4011  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  55.58 
 
 		 440 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3827  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  55.58 
 
 		 440 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3726  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  55.35 
 
 		 440 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3928  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  55.58 
 
 		 440 aa  401  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0194  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  55.35 
 
 		 440 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4886  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  55.35 
 
 		 440 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03371  predicted transporter  55.13 
 
 		 440 aa  398  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03324  hypothetical protein  55.13 
 
 		 440 aa  398  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2079  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  50.8 
 
 		 436 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  hitchhiker  0.0017507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3816  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  54.67 
 
 		 440 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3803  MFS transporter metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  54.67 
 
 		 440 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3881  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  55.13 
 
 		 440 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3984  MFS transporter metabolite:H+ symporter family protein  54.67 
 
 		 440 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.139706 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3925  MFS transporter/metabolite:H+ symporter family protein  54.67 
 
 		 440 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2850  General substrate transporter  49.66 
 
 		 437 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.290987  hitchhiker  0.00573587 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3269  major facilitator superfamily MFS_1  53.01 
 
 		 436 aa  380  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2741  general substrate transporter  49.44 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2691  general substrate transporter  48.31 
 
 		 445 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2736  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  50.23 
 
 		 438 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0663  general substrate transporter  50.57 
 
 		 435 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0269429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2036  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  53.41 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70971  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0706  major facilitator family transporter  50.68 
 
 		 426 aa  365  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3101  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  49.54 
 
 		 438 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4263  general substrate transporter  50.56 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1332  major facilitator superfamily MFS_1  50.11 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423362 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2888  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  49.22 
 
 		 434 aa  364  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1063  major facilitator superfamily MFS_1  49.43 
 
 		 435 aa  363  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3830  major facilitator transporter  50.68 
 
 		 463 aa  363  3e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1015  general substrate transporter  50.33 
 
 		 438 aa  363  4e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1458  metabolite-proton symporter  50.34 
 
 		 432 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202966  normal  0.170493 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1063  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  50.11 
 
 		 432 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0512  general substrate transporter  48.41 
 
 		 483 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.509539  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00467  metabolite transport protein  50.58 
 
 		 412 aa  361  1e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0863  general substrate transporter  48.64 
 
 		 437 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3419  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  49.66 
 
 		 435 aa  361  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0951  general substrate transporter  48.4 
 
 		 436 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0991  general substrate transporter  48.41 
 
 		 436 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0201608  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1278  citrate-proton symport  49.44 
 
 		 456 aa  360  4e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4094  major facilitator transporter  48.18 
 
 		 436 aa  359  6e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0851  general substrate transporter  48.64 
 
 		 437 aa  359  6e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.80283  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4973  major facilitator transporter  47.95 
 
 		 425 aa  357  2.9999999999999997e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2408  general substrate transporter  47.95 
 
 		 436 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4161  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  50.66 
 
 		 433 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1469  major facilitator family transporter  49.22 
 
 		 438 aa  353  5e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0457955  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2238  major facilitator transporter  48.54 
 
 		 442 aa  350  3e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.451405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0806  metabolite:proton symporter family protein  47.07 
 
 		 523 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.413485  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3059  metabolite:proton symporter family protein  47.07 
 
 		 489 aa  349  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2961  major facilitator superfamily permease  47.3 
 
 		 437 aa  349  5e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1576  metabolite:proton symporter family protein  46.85 
 
 		 506 aa  348  9e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342246  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3026  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  47.07 
 
 		 437 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1974  metabolite:proton symporter family protein  47.07 
 
 		 437 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2106  metabolite:proton symporter family protein  47.07 
 
 		 437 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.22377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2638  metabolite:proton symporter family protein  47.07 
 
 		 437 aa  348  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15920  major facilitator transporter  49.66 
 
 		 437 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.246808 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0161  major facilitator transporter  45.98 
 
 		 440 aa  342  7e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2710  major facilitator superfamily MFS_1  48.39 
 
 		 420 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2856  metabolite transport protein  48.05 
 
 		 439 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2487  major facilitator transporter  48.39 
 
 		 420 aa  339  7e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1369  MFS family transporter  50.11 
 
 		 437 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2415  major facilitator superfamily MFS_1  49.89 
 
 		 420 aa  334  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.89 
 
 		 839 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.834147 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4279  major facilitator transporter  46.12 
 
 		 426 aa  320  3.9999999999999996e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.646646 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3744  General substrate transporter  39.31 
 
 		 465 aa  306  7e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0662  major facilitator family transporter  45.66 
 
 		 393 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1295  general substrate transporter  45.48 
 
 		 423 aa  303  3.0000000000000004e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659237  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1510  major facilitator transporter  43.3 
 
 		 425 aa  301  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  37.64 
 
 		 459 aa  301  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  43.41 
 
 		 441 aa  299  7e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  41.11 
 
 		 440 aa  296  7e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  37.61 
 
 		 458 aa  295  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  41.53 
 
 		 446 aa  292  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  38.51 
 
 		 459 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 432 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 432 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  42.45 
 
 		 432 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  40.13 
 
 		 437 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  37.84 
 
 		 459 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2568  general substrate transporter  37.25 
 
 		 444 aa  286  7e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  39.82 
 
 		 456 aa  285  9e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170297  normal  0.0989418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>